我有一个2D NumPy数组,想用255.0替换其中大于或等于阈值T的所有值。据我所知,最基本的方法是:

shape = arr.shape
result = np.zeros(shape)
for x in range(0, shape[0]):
    for y in range(0, shape[1]):
        if arr[x, y] >= T:
            result[x, y] = 255

最简洁和python化的方法是什么? 是否有更快(可能不那么简洁和/或不那么python化)的方法来做到这一点?

这将是人类头部MRI扫描的窗口/水平调整子程序的一部分。2D numpy数组是图像像素数据。


当前回答

因为你实际上想要一个不同的数组,它是arr,其中arr < 255,否则是255,这可以简单地完成:

result = np.minimum(arr, 255)

更一般地说,对于下限和/或上限:

result = np.clip(arr, 0, 255)

如果您只想访问255以上的值,或者更复杂的值,@mtitan8的答案更一般,但它是np。Clip和np。Minimum(或np.maximum)对你的情况更好,更快:

In [292]: timeit np.minimum(a, 255)
100000 loops, best of 3: 19.6 µs per loop

In [293]: %%timeit
   .....: c = np.copy(a)
   .....: c[a>255] = 255
   .....: 
10000 loops, best of 3: 86.6 µs per loop

如果你想在原地(即修改arr而不是创建结果),你可以使用np.minimum的out参数:

np.minimum(arr, 255, out=arr)

or

np.clip(arr, 0, 255, arr)

(out= name是可选的,因为参数的顺序与函数的定义相同。)

对于原地修改,布尔索引加快了很多(不需要单独创建和修改副本),但仍然没有最小值那么快:

In [328]: %%timeit
   .....: a = np.random.randint(0, 300, (100,100))
   .....: np.minimum(a, 255, a)
   .....: 
100000 loops, best of 3: 303 µs per loop

In [329]: %%timeit
   .....: a = np.random.randint(0, 300, (100,100))
   .....: a[a>255] = 255
   .....: 
100000 loops, best of 3: 356 µs per loop

作为比较,如果你想用最小值和最大值来限制你的值,如果没有clip,你就必须这样做两次

np.minimum(a, 255, a)
np.maximum(a, 0, a)

or,

a[a>255] = 255
a[a<0] = 0

其他回答

Np.where()工作得很好!

np.where(arr > 255, 255, arr)

例子:

FF = np.array([[0, 0],
              [1, 0],
              [0, 1],
              [1, 1]])
np.where(FF == 1, '+', '-')
Out[]: 
array([['-', '-'],
       ['+', '-'],
       ['-', '+'],
       ['+', '+']], dtype='<U1')

你可以考虑使用numpy.putmask:

np.putmask(arr, arr>=T, 255.0)

下面是Numpy内置索引的性能比较:

In [1]: import numpy as np
In [2]: A = np.random.rand(500, 500)

In [3]: timeit np.putmask(A, A>0.5, 5)
1000 loops, best of 3: 1.34 ms per loop

In [4]: timeit A[A > 0.5] = 5
1000 loops, best of 3: 1.82 ms per loop

你也可以使用&,|(和/或)来获得更大的灵活性:

值在5到10之间:A[(A>5)&(A<10)]

值大于10或小于5:A[(A<5)|(A>10)]

让我们假设您有一个numpy数组,其中包含从0到20的值,并且您想用0替换大于10的数字

import numpy as np

my_arr = np.arange(0,21) # creates an array
my_arr[my_arr > 10] = 0 # modifies the value

请注意,这将修改原始数组,以避免覆盖原始数组,尝试使用arr.copy()来创建一个新的原始数组的分离副本,并修改它。

import numpy as np

my_arr = np.arange(0,21)
my_arr_copy = my_arr.copy() # creates copy of the orignal array

my_arr_copy[my_arr_copy > 10] = 0 

我认为你可以通过使用where函数最快地实现这一点:

例如,在numpy数组中查找大于0.2的项,并将其替换为0:

import numpy as np

nums = np.random.rand(4,3)

print np.where(nums > 0.2, 0, nums)