我推荐gRaphaël的纯JavaScript图表以及它所构建的纯JavaScript矢量图形库(Raphaël)。

gRaphaël目前支持Firefox 3.0+， Safari 3.0+， Opera 9.5+和Internet Explorer 6.0+。

jqPlot很棒。如果你的需求相当“正常”，你只是想画一些图表，你可能会被大量的js图表选项所淹没。假设您不想花费数小时进行研究，那么就使用jqPlot，因为它可能是您最好的选择。它很好地涵盖了大多数人的大多数用例。一些替代方案专门针对特定类型的图表，或者根据特定的用例构建。

还有另一个基于SVG的javascript库。它被称为Protovis，来自斯坦福可视化小组

它还允许制作漂亮的交互式图形和可视化。

http://vis.stanford.edu/protovis/ex/

尽管它只适用于现代网络浏览器

更新:protovis团队已经迁移到另一个名为d3.js(数据驱动文档)的库，正如他们所说:

Protovis团队现在正在开发一个新的可视化库D3.js，改进了对动画和交互的支持。D3建立在Protovis的许多概念之上。”

新库现在可以在以下地址找到:

http://mbostock.github.com/d3/

更新2:

“Rickshaw”是一个用于创建交互式时间序列图的JavaScript工具包。基于d3.js，这大大简化了d3.js的工作，尽管功能有点不强大。

http://code.shutterstock.com/rickshaw/

可能不是OP所寻找的，但由于这个问题已经成为JS图表库选项列表:jQuery Sparklines真的很酷。

http://code.google.com/apis/visualization/documentation/gallery.html

有非常酷的互动选项，包括地图，仪表和图表。

有越来越多的纯JavaScript图表的开源和商业解决方案不需要Flash。在这个回答中，我将只介绍开源选项。

对于不需要Flash的图像，有两类主要的JavaScript解决方案:

基于画布的，在IE中使用ExplorerCanvas渲染，这反过来依赖于VML 基于标准的浏览器上的SVG，在IE中呈现为VML

这两种方法各有利弊，但对于图表库，我推荐后者，因为它与DOM集成得很好，允许使用DOM操作图表元素，最重要的是设置DOM事件。相比之下，Canvas图表库必须重新发明DOM轮来管理事件。因此，除非您打算构建没有事件处理的静态图形，否则SVG/VML解决方案应该更好。

对于SVG/VML解决方案，有许多选项，包括:

Dojox图表，如果您已经使用了Dojo工具包，那就很好 Raphael-based解决方案

Raphael是一个非常活跃，维护良好，成熟的开源图形库，具有非常好的跨浏览器支持，包括IE 6到8,Firefox, Opera, Safari, Chrome和Konqueror。Raphael不依赖于任何JavaScript框架，因此可以使用Prototype, jQuery, Dojo, Mootools等…

有许多基于拉斐尔的图表库，包括(但不限于):

gRaphael, Raphael图形库的扩展 Ico，具有基于单个函数调用的直观API来创建复杂的图表

披露:我是github上Ico分支之一的开发者。