我有同样的问题，每当我尝试合并主在我的本地分支它说

以下未跟踪的工作树文件将被合并M.xcworkspace/xcshareddata/swiftpm/Package.resolved覆盖

但以上任何一个答案对我都不起作用。当我做git状态没有未跟踪的文件，所以当我做git添加。没有文件得到阶段性，因此存储不能解决问题，也不能像上面回答的那样强制签出。

我可以通过运行上面提到的命令来解决这个问题，但更重要的是，我必须关闭Xcode(即使在运行干净命令后，它也可能会创建导致我出现问题的文件)。

Git clean -dfxn(检查什么可以删除)

Git清除-d -fx。(删除上述文件)

问题是，当我们有传入的更改，将合并未跟踪的文件，git抱怨。这些命令帮助了我:

git clean -dxf
git pull origin master

如果这是一次性操作，那么在执行拉取操作之前，可以从工作目录中删除所有未跟踪的文件。阅读如何从当前Git工作树中删除本地(未跟踪)文件?有关如何删除所有未跟踪的文件的信息。

请确保不要意外删除未跟踪的文件，你仍然需要;)

如果你考虑使用-f标志，你可以先运行它作为一个演练。你只需要提前知道你接下来会遇到什么样有趣的情况;-P

-n 
--dry-run 
    Don’t actually remove anything, just show what would be done.

步骤1:清理工作副本

a)将本地更改保存在Stash上 如果想要保存本地更改，可以安全地将它们存储在Stash上。它们将是可用的，以防你以后想要回来。

$ git stash --include-untracked

b)丢弃局部更改 如果你确定你不再需要它们，你可以完全放弃你的本地更改:

$ git reset --hard

c)如果你也有未跟踪的/新的文件，你将不得不使用“git clean”命令来清除这些文件:

$ git clean -fd

第二步:再拉一次 当你清理了所有可能被覆盖的本地更改/未跟踪的文件后，pull将最终工作:

$ git pull

问题是你没有在本地跟踪文件，但是相同的文件被远程跟踪，所以为了“拉”你的系统将被迫覆盖不受版本控制的本地文件。

尝试运行

git add * 
git stash
git pull

这将跟踪所有文件，删除对这些文件的所有本地更改，然后从服务器获取这些文件。