我发现的最简单的方法是由leontalbot(作为评论)提出的，这是Anoopjohn发表的一篇文章。我认为有必要用自己的空间来回答:

(我将其转换为bash脚本)

#!/bin/bash
if [[ $1 == "" ]]; then
    echo "Usage: $0 FILE_OR_DIR [remote]";
    echo "FILE_OR_DIR: the file or directory you want to remove from history"
    echo "if 'remote' argument is set, it will also push to remote repository."
    exit;
fi
FOLDERNAME_OR_FILENAME=$1;

#The important part starts here: ------------------------

git filter-branch -f --index-filter "git rm -rf --cached --ignore-unmatch $FOLDERNAME_OR_FILENAME" -- --all
rm -rf .git/refs/original/
git reflog expire --expire=now --all
git gc --prune=now
git gc --aggressive --prune=now

if [[ $2 == "remote" ]]; then
    git push --all --force
fi
echo "Done."

所有的功劳都归于Annopjohn和leontalbot，感谢他们指出了这一点。

NOTE

请注意，脚本不包括验证，因此请确保不会出错，并有备份以防出现错误。这招对我很管用，但对你可能就不管用了。小心使用它(如果你想知道发生了什么，请点击链接)。

重写Git历史记录需要更改所有受影响的提交id，因此每个参与项目的人都需要删除他们的旧回购副本，并在清理历史记录后进行新的克隆。它给人带来的不便越多，你就越需要一个好的理由来这样做——你多余的文件并没有真正造成问题，但如果你只是在做这个项目，你也可以清理Git历史记录，如果你想的话!

为了尽可能简单，我建议使用BFG Repo-Cleaner，这是一个更简单、更快的Git -filter-branch的替代方案，专门用于从Git历史记录中删除文件。它让你的生活更轻松的一种方式是它实际上默认处理所有的引用(所有标签，分支等)，但它也快了10 - 50倍。

你应该仔细遵循以下步骤:http://rtyley.github.com/bfg-repo-cleaner/#usage -但核心是:下载BFG jar(需要Java 6或以上)并运行以下命令:

$ java -jar bfg.jar --delete-files filename.orig my-repo.git

您的整个存储库历史将被扫描，任何名为filename的文件。origin(不在最近一次提交中)将被删除。这比使用git-filter-branch做同样的事情要容易得多!

完全披露:我是好心眼巨人回收清理器的作者。

这就是git filter-branch的设计目的。

如果你的情况不是问题中描述的情况，请不要使用这个方法。这个配方是用来修复一个坏的合并，并在一个固定的合并中重新播放你好的提交。

尽管filter-branch会做你想做的事情，但这是一个相当复杂的命令，我可能会选择用git rebase来做这件事。这可能是个人喜好。Filter-branch可以在一个稍微复杂一点的命令中完成，而rebase解决方案则是一次执行一步等效的逻辑操作。

试试下面的食谱:

# create and check out a temporary branch at the location of the bad merge
git checkout -b tmpfix <sha1-of-merge>

# remove the incorrectly added file
git rm somefile.orig

# commit the amended merge
git commit --amend

# go back to the master branch
git checkout master

# replant the master branch onto the corrected merge
git rebase tmpfix

# delete the temporary branch
git branch -d tmpfix

(注意，你实际上不需要一个临时分支，你可以用一个'detached HEAD'来做到这一点，但你需要注意git commit——modify步骤生成的提交id，以提供给git rebase命令，而不是使用临时分支名称。)

如果你还没有提交任何东西，只需git rm文件和git commit——modify。

如果你有

git filter-branch \
--index-filter 'git rm --cached --ignore-unmatch path/to/file/filename.orig' merge-point..HEAD

将从合并点到HEAD，删除文件名的每个更改。创建并重写更改。使用——ignore-unmatch意味着如果由于某种原因filename. conf命令不会失败。奥里格在变化中消失了。这是git-filter-branch手册页中的示例部分推荐的方法。

Windows用户注意:文件路径必须使用正斜杠

你还可以使用:

git重置HEAD文件/路径