我发现的最简单的方法是由leontalbot(作为评论)提出的，这是Anoopjohn发表的一篇文章。我认为有必要用自己的空间来回答:

(我将其转换为bash脚本)

#!/bin/bash
if [[ $1 == "" ]]; then
    echo "Usage: $0 FILE_OR_DIR [remote]";
    echo "FILE_OR_DIR: the file or directory you want to remove from history"
    echo "if 'remote' argument is set, it will also push to remote repository."
    exit;
fi
FOLDERNAME_OR_FILENAME=$1;

#The important part starts here: ------------------------

git filter-branch -f --index-filter "git rm -rf --cached --ignore-unmatch $FOLDERNAME_OR_FILENAME" -- --all
rm -rf .git/refs/original/
git reflog expire --expire=now --all
git gc --prune=now
git gc --aggressive --prune=now

if [[ $2 == "remote" ]]; then
    git push --all --force
fi
echo "Done."

所有的功劳都归于Annopjohn和leontalbot，感谢他们指出了这一点。

NOTE

请注意，脚本不包括验证，因此请确保不会出错，并有备份以防出现错误。这招对我很管用，但对你可能就不管用了。小心使用它(如果你想知道发生了什么，请点击链接)。

如果这是你想要清理的最新提交，我尝试使用git版本2.14.3 (Apple git -98):

touch empty
git init
git add empty
git commit -m init

# 92K   .git
du -hs .git

dd if=/dev/random of=./random bs=1m count=5
git add random
git commit -m mistake

# 5.1M  .git
du -hs .git

git reset --hard HEAD^
git reflog expire --expire=now --all
git gc --prune=now

# 92K   .git
du -hs .git

这是最好的方法: http://github.com/guides/completely-remove-a-file-from-all-revisions

一定要先备份文件副本。

EDIT

Neon的编辑在审查过程中不幸被拒绝了。 请看下面的霓虹灯帖子，它可能包含有用的信息!

例如，删除所有不小心提交到git仓库的*.gz文件:

$ du -sh .git ==> e.g. 100M
$ git filter-branch --index-filter 'git rm --cached --ignore-unmatch *.gz' HEAD
$ git push origin master --force
$ rm -rf .git/refs/original/
$ git reflog expire --expire=now --all
$ git gc --prune=now
$ git gc --aggressive --prune=now

还是不管用吗?(我现在的git版本是1.7.6.1)

$ du -sh .git ==> e.g. 100M

不知道为什么，因为我只有一个主分支。无论如何，我终于得到了我的git回购真正清理了推到一个新的空的和裸露的git仓库，例如。

$ git init --bare /path/to/newcleanrepo.git
$ git push /path/to/newcleanrepo.git master
$ du -sh /path/to/newcleanrepo.git ==> e.g. 5M 

(是的!)

然后我把它克隆到一个新目录，并把它的。git文件夹移动到这个目录。如。

$ mv .git ../large_dot_git
$ git clone /path/to/newcleanrepo.git ../tmpdir
$ mv ../tmpdir/.git .
$ du -sh .git ==> e.g. 5M 

(是的!)终于清理干净了!)

在确认一切正常后，您可以删除../large_dot_git和../tmpdir目录(可能在几周或几个月后，以防万一……)

You should probably clone your repository first.

Remove your file from all branches history:
git filter-branch --tree-filter 'rm -f filename.orig' -- --all

Remove your file just from the current branch:
git filter-branch --tree-filter 'rm -f filename.orig' -- --HEAD    

Lastly you should run to remove empty commits:
git filter-branch -f --prune-empty -- --all

重写Git历史记录需要更改所有受影响的提交id，因此每个参与项目的人都需要删除他们的旧回购副本，并在清理历史记录后进行新的克隆。它给人带来的不便越多，你就越需要一个好的理由来这样做——你多余的文件并没有真正造成问题，但如果你只是在做这个项目，你也可以清理Git历史记录，如果你想的话!

为了尽可能简单，我建议使用BFG Repo-Cleaner，这是一个更简单、更快的Git -filter-branch的替代方案，专门用于从Git历史记录中删除文件。它让你的生活更轻松的一种方式是它实际上默认处理所有的引用(所有标签，分支等)，但它也快了10 - 50倍。

你应该仔细遵循以下步骤:http://rtyley.github.com/bfg-repo-cleaner/#usage -但核心是:下载BFG jar(需要Java 6或以上)并运行以下命令:

$ java -jar bfg.jar --delete-files filename.orig my-repo.git

您的整个存储库历史将被扫描，任何名为filename的文件。origin(不在最近一次提交中)将被删除。这比使用git-filter-branch做同样的事情要容易得多!

完全披露:我是好心眼巨人回收清理器的作者。

你还可以使用:

git重置HEAD文件/路径