我的一位同事建议BFG Repo Cleaner，我认为它很强大。它不仅可以删除不需要的数据，还可以清除存储库中的任何相关提交信息。

如果您正在从GitHub web应用程序中删除目录，您将找到一个删除选项。然而，在这之后，它会给你一个被删除的文件列表，底部有提交选项。请记住提交它。否则，目录将不会被删除。

参考-https://docs.github.com/en/repositories/working-with-files/managing-files/deleting-files-in-a-repository

这两个答案的组合对我有用

git rm -r one-of-the-directories
git commit . -m "Remove duplicated directory"
git push

如果仍然显示一些警告，请手动删除文件

git filter-branch --tree-filter 'rm -rf path/to/your/file' HEAD
git push

我通常使用gitadd-all从远程存储库中删除文件/文件夹

rm -r folder_name
git add --all
git commit -m "some comment"
git push origin master

master可以被存储库的任何其他分支替换。

要添加新目录：

mkdir <YOUR-DIRECTORY>

但是现在Git不知道这个新目录，因为Git跟踪的是文件而不是目录目录

git status

Git不会意识到我们所做的更改，所以我们添加了hidden.keep文件，以使Git意识到新的更改。

touch /YOUR-directory/.keep

现在，如果你点击git状态，git就会知道这些变化。

如果要删除目录，则应使用此命令。

rm -r <YOUR-DIRECTORY>

如果您使用gitstatus进行检查，您将看到目录已被删除。

我之前已经提交了该文件夹，并希望删除历史记录中的目录。

我执行了以下操作：

将文件夹添加到.gitignore：

echo Folder_Name/ >> .gitignore

从所有提交中删除：

git filter-branch --index-filter 'git rm -rf --cached --ignore-unmatch Folder_Name/' --prune-empty --tag-name-filter cat -- --all

从旧提交中删除refs：

git for-each-ref --format="%(refname)" refs/original/ | xargs -n 1 git update-ref -d

确保完全删除所有旧引用

rm -Rf .git/logs .git/refs/original

执行垃圾收集

git gc --prune=all --aggressive

将更改推送到在线存储库：

git push

你到此为止。

但您可以通过以下操作将所有更改推送到所有分支：但是要小心这个命令！

git push origin --all --force
git push origin --tags --force

之后，该文件夹从git中删除，但没有从本地磁盘中删除。