虽然姗姗来迟，但我认为这个添加可能对使用rmarkdown的人有用。在rmarkdown中，有内置的文档头引用支持。

定义的任何头

# Header

可由

get me back to that [header](#header)

下面是一个最小的独立.rmd文件，它显示了这种行为。它可以编织成。pdf和。html。

---
title: "references in rmarkdown"
output:
  html_document: default
  pdf_document: default
---

# Header

Write some more text. Write some more text. Write some more text. Write some more text. Write some more text. Write some more text. Write some more text. Write some more text. Write some more text. Write some more text. Write some more text. 

Go back to that [header](#header).

使用最新的Markdown，你应该能够使用以下语法:

[] () {: name =‘anchorName}

这将创建以下HTML:

<a name=“anchorName”></a>

如果你想要锚点有文本，只需在方括号内添加锚点文本:

[文本](){:name = ' anchorName '}

在最初的Markdown语法中没有现成的语法来做到这一点，但是Markdown Extra提供了一种方法，至少可以将id分配给标题-然后可以轻松地链接到标题。还要注意，您可以在Markdown和Markdown Extra中使用常规HTML，并且在最新版本的HTML中，name属性已经被id属性所取代。

正如我们所看到的(从答案中)，这没有标准的方法;不同的降价处理器在提供这种可能性的降价扩展方面会有所不同。

使用pandoc，你可以得到你想要的:

Take me to [pookie](#pookie)

...

[this is pookie]{#pookie}

这给出了(通过pandoc-2.9.2.1):

<p>Take me to <a href="#pookie">pookie</a></p>
<p>…</p>
<p><span id="pookie">this is pookie</span></p>

我们也可以用一个锚id创建一个空span:

Take me to [pookie](#pookie)

...

this is pookie []{#pookie}

这将产生:

<p>Take me to <a href="#pookie">pookie</a></p>
<p>…</p>
<p>this is pookie <span id="pookie"></span></p>

除此之外，对于pandoc和大多数常见的markdown生成器，在每个报头中都有一个简单的自生成锚。(请参阅此处和其他答案，以方便地(自动)生成和引用此类锚。)

使用一个名字。在HTML 5中不需要使用id，它会在JavaScript中创建全局变量

参见HTML 5规范，5.9.8导航到片段标识符- id和name都被使用。

重要的是要知道大多数浏览器仍然将id转换为全局变量。这里有一个快速测试。使用名称可以避免创建全局变量和可能导致的任何冲突。

使用名称的示例:

Take me to [pookie](#pookie)

和目的锚点:

### <a name="pookie"></a>Some heading

对于大多数常见的降价生成器。在每个头文件中都有一个简单的自生成锚。例如，使用pandoc，生成的锚将是头部的一个烤肉盒。

 echo "# Hello, world\!" | pandoc
 # => <h1 id="hello-world">Hello, world!</h1>

取决于您使用的markdown解析器，锚可以改变(以symbolrush和La muerte Peluda回答为例，它们是不同的!)。看这个babelmark，你可以看到生成的锚取决于你的markdown实现。