你可以使用2个div:

你可以在上面放一个复制品，然后在把复制品淡入的同时把原来的淡出。

当淡出完成后，用新的bg恢复原始。

$(function(){
    var $mytd = $('#mytd'), $elie = $mytd.clone(), os = $mytd.offset();

      // Create clone w other bg and position it on original
    $elie.toggleClass("class1, class2").appendTo("body")
         .offset({top: os.top, left: os.left}).hide();

    $mytd.mouseover(function() {            
          // Fade original
        $mytd.fadeOut(3000, function() {
            $mytd.toggleClass("class1, class2").show();
            $elie.toggleClass("class1, class2").hide();            
        });
          // Show clone at same time
        $elie.fadeIn(3000);
    });
});​

jsFiddle例子

.toggleClass（） .offset（） .fadeIn（） .淡出（）

我也有同样的问题，并通过包含jQuery UI来修复它。以下是完整的脚本:

<!-- include Google's AJAX API loader -->
<script src="http://www.google.com/jsapi"></script>
<!-- load JQuery and UI from Google (need to use UI to animate colors) -->
<script type="text/javascript">
google.load("jqueryui", "1.5.2");
</script>


<script type="text/javascript">
$(document).ready(function() {
$('#menu ul li.item').hover(
    function() {
        $(this).stop().animate({backgroundColor:'#4E1402'}, 300);
        }, function () {
        $(this).stop().animate({backgroundColor:'#943D20'}, 100);
    });
});
</script>

如果有人发现了这个。你最好使用jQuery UI版本，因为它可以在所有浏览器上运行。颜色插件在Safari和Chrome浏览器中存在问题。只是有时候有用。

你可以使用jQuery UI来添加这个功能。你可以抓取你所需要的，所以如果你想动画颜色，你所需要包括的是下面的代码。我得到了如果从最新的jQuery UI(目前1.8.14)

/******************************************************************************/
/****************************** COLOR ANIMATIONS ******************************/
/******************************************************************************/

// override the animation for color styles
$.each(['backgroundColor', 'borderBottomColor', 'borderLeftColor',
    'borderRightColor', 'borderTopColor', 'borderColor', 'color', 'outlineColor'],
function(i, attr) {
    $.fx.step[attr] = function(fx) {
        if (!fx.colorInit) {
            fx.start = getColor(fx.elem, attr);
            fx.end = getRGB(fx.end);
            fx.colorInit = true;
        }

        fx.elem.style[attr] = 'rgb(' +
            Math.max(Math.min(parseInt((fx.pos * (fx.end[0] - fx.start[0])) + fx.start[0], 10), 255), 0) + ',' +
            Math.max(Math.min(parseInt((fx.pos * (fx.end[1] - fx.start[1])) + fx.start[1], 10), 255), 0) + ',' +
            Math.max(Math.min(parseInt((fx.pos * (fx.end[2] - fx.start[2])) + fx.start[2], 10), 255), 0) + ')';
    };
});

// Color Conversion functions from highlightFade
// By Blair Mitchelmore
// http://jquery.offput.ca/highlightFade/

// Parse strings looking for color tuples [255,255,255]
function getRGB(color) {
        var result;

        // Check if we're already dealing with an array of colors
        if ( color && color.constructor == Array && color.length == 3 )
                return color;

        // Look for rgb(num,num,num)
        if (result = /rgb\(\s*([0-9]{1,3})\s*,\s*([0-9]{1,3})\s*,\s*([0-9]{1,3})\s*\)/.exec(color))
                return [parseInt(result[1],10), parseInt(result[2],10), parseInt(result[3],10)];

        // Look for rgb(num%,num%,num%)
        if (result = /rgb\(\s*([0-9]+(?:\.[0-9]+)?)\%\s*,\s*([0-9]+(?:\.[0-9]+)?)\%\s*,\s*([0-9]+(?:\.[0-9]+)?)\%\s*\)/.exec(color))
                return [parseFloat(result[1])*2.55, parseFloat(result[2])*2.55, parseFloat(result[3])*2.55];

        // Look for #a0b1c2
        if (result = /#([a-fA-F0-9]{2})([a-fA-F0-9]{2})([a-fA-F0-9]{2})/.exec(color))
                return [parseInt(result[1],16), parseInt(result[2],16), parseInt(result[3],16)];

        // Look for #fff
        if (result = /#([a-fA-F0-9])([a-fA-F0-9])([a-fA-F0-9])/.exec(color))
                return [parseInt(result[1]+result[1],16), parseInt(result[2]+result[2],16), parseInt(result[3]+result[3],16)];

        // Look for rgba(0, 0, 0, 0) == transparent in Safari 3
        if (result = /rgba\(0, 0, 0, 0\)/.exec(color))
                return colors['transparent'];

        // Otherwise, we're most likely dealing with a named color
        return colors[$.trim(color).toLowerCase()];
}

function getColor(elem, attr) {
        var color;

        do {
                color = $.curCSS(elem, attr);

                // Keep going until we find an element that has color, or we hit the body
                if ( color != '' && color != 'transparent' || $.nodeName(elem, "body") )
                        break;

                attr = "backgroundColor";
        } while ( elem = elem.parentNode );

        return getRGB(color);
};

用YUI压缩后只有1.43kb:

$.each(["backgroundColor","borderBottomColor","borderLeftColor","borderRightColor","borderTopColor","borderColor","color","outlineColor"],function(b,a){$.fx.step[a]=function(c){if(!c.colorInit){c.start=getColor(c.elem,a);c.end=getRGB(c.end);c.colorInit=true}c.elem.style[a]="rgb("+Math.max(Math.min(parseInt((c.pos*(c.end[0]-c.start[0]))+c.start[0],10),255),0)+","+Math.max(Math.min(parseInt((c.pos*(c.end[1]-c.start[1]))+c.start[1],10),255),0)+","+Math.max(Math.min(parseInt((c.pos*(c.end[2]-c.start[2]))+c.start[2],10),255),0)+")"}});function getRGB(b){var a;if(b&&b.constructor==Array&&b.length==3){return b}if(a=/rgb\(\s*([0-9]{1,3})\s*,\s*([0-9]{1,3})\s*,\s*([0-9]{1,3})\s*\)/.exec(b)){return[parseInt(a[1],10),parseInt(a[2],10),parseInt(a[3],10)]}if(a=/rgb\(\s*([0-9]+(?:\.[0-9]+)?)\%\s*,\s*([0-9]+(?:\.[0-9]+)?)\%\s*,\s*([0-9]+(?:\.[0-9]+)?)\%\s*\)/.exec(b)){return[parseFloat(a[1])*2.55,parseFloat(a[2])*2.55,parseFloat(a[3])*2.55]}if(a=/#([a-fA-F0-9]{2})([a-fA-F0-9]{2})([a-fA-F0-9]{2})/.exec(b)){return[parseInt(a[1],16),parseInt(a[2],16),parseInt(a[3],16)]}if(a=/#([a-fA-F0-9])([a-fA-F0-9])([a-fA-F0-9])/.exec(b)){return[parseInt(a[1]+a[1],16),parseInt(a[2]+a[2],16),parseInt(a[3]+a[3],16)]}if(a=/rgba\(0, 0, 0, 0\)/.exec(b)){return colors.transparent}return colors[$.trim(b).toLowerCase()]}function getColor(c,a){var b;do{b=$.curCSS(c,a);if(b!=""&&b!="transparent"||$.nodeName(c,"body")){break}a="backgroundColor"}while(c=c.parentNode);return getRGB(b)};

你也可以使用CSS3过渡动画颜色，但它只支持现代浏览器。

a.test {
  color: red;
  -moz-transition-property: color;  /* FF4+ */
  -moz-transition-duration: 1s;
  -webkit-transition-property: color;  /* Saf3.2+, Chrome */
  -webkit-transition-duration: 1s;
  -o-transition-property: color;  /* Opera 10.5+ */
  -o-transition-duration: 1s;
  -ms-transition-property: color;  /* IE10? */
  -ms-transition-duration: 1s;
  transition-property: color;  /* Standard */
  transition-duration: 1s;
  }

  a.test:hover {
  color: blue;
  }

使用速记属性:

/* shorthand notation for transition properties */
/* transition: [transition-property] [transition-duration] [transition-timing-function] [transition-delay]; */

a.test {
  color: red;
  -moz-transition: color 1s;
  -webkit-transition: color 1s;
  -o-transition: color 1s;
  -ms-transition: color 1s;
  transition: color 1s;
  }

a.test {
  color: blue;
 }

与常规的javascript转换不同，CSS3的转换是硬件加速的，因此更流畅。你可以使用Modernizr，看看浏览器是否支持CSS3转换，如果不支持，你可以使用jQuery作为退路:

if ( !cssTransitions() ) {
    $(document).ready(function(){
        $(".test").hover(function () {
                $(this).stop().animate({ backgroundColor: "red" },500)
             }, function() {
                 $(this).stop().animate({ backgroundColor: "blue" },500)}    
             );
    }); 
}

记住在开始一个新的动画之前使用stop()来停止当前动画，否则当你过快地传递元素时，效果会持续闪烁一段时间。

ColorBlend插件完全是你想要的

http://plugins.jquery.com/project/colorBlend

这里是我的高亮代码

$("#container").colorBlend([{
    colorList:["white",  "yellow"], 
    param:"background-color",
    cycles: 1,
    duration: 500
}]);

Bitstorm拥有我见过的最好的jquery彩色动画插件。这是对jquery颜色项目的改进。它还支持rgba。

http://www.bitstorm.org/jquery/color-animation/