IntelliJ IDEA有一个名为“压缩空中间包”的选项。选择“项目”选项卡的选项图标，然后取消/激活该选项。

请参阅：如何更改IntelliJ IDEA中的顶级包名称？

更改应用程序ID（现在独立于包名）可以在一个步骤中轻松完成。你不必接触AndroidManifest。相反，请执行以下操作：

右键单击项目的根文件夹。单击“打开模块设置”。转到“口味”选项卡。将applicationID更改为所需的任何包名称。按OK（确定）。

注意，这不会更改包名称。包名称和应用程序ID的解耦在这里解释：http://tools.android.com/tech-docs/new-build-system/applicationid-vs-packagename

一定要去Sheharyar的伟大答案。随之而来的答案和评论太多，很容易让人感到困惑和放弃，但不要。这个答案有效。

简而言之，你要做三件事：

（1） 取消选择压缩空中间包装。

（2） 然后，通过选择“更改包”（而不是“更改目录”）来重命名每个旧目录节点，以匹配新的包名称。（请务必预览更改。）

（3） 编辑build.gradle文件，使APPLICATION_ID与新的包名匹配。

转到项目路径>找到Java文件和包的位置创建新文件夹，例如com→ 超级程序包→ 活动Android Studio将刷新项目结构将所有Java文件移动到新文件夹删除旧文件夹菜单编辑→ 发现→ 替换路径：将旧包名称更改为新包舱单和建造坡度也发生变化

完成！

如何将com.example.app重命名为com.android.app：

在包com.example.app中选择示例移位+F6选择重命名包将示例重命名为android确认进行重构

这对我来说非常有效，即使是更改所有相关模块中的引用，也可以更改我想在包中修改的文件夹名称，但对我来说，只有完全按照以下步骤操作，这才有效：

A-如果您想更改根文件夹的名称（换句话说，通常在包中用于包含主要活动的文件夹的名称），可以在以下步骤（B到C）之前或之后通过退出“Android Studio”手动重命名此根文件夹。单击“导入项目…”，然后单击项目的新名称（此导入过程将自动使用项目文件重新调整“Gradle”文件）B-在接下来的C步骤之前，不要忘记手动修改要在包中更改的文件夹名称，方法是在以下3个文件中更改它们：“AndroidManifest.xml”、“MainActivity.java”（或您最终为第一个活动选择的名称）和“build.gradle（Module:app）”文件。C-按照上述步骤1至6（“在项目窗格中，单击小齿轮图标…”）->https://stackoverflow.com/a/29092698/2001610 D-仅当您现在想要更改根文件夹的名称时，您可以按照上面所述的“A”过程进行操作。