就像Travis Heeter在他的回答中提到的，试试下面的命令序列:

git lfs uninstall
git reset --hard
git lfs install
git lfs pull

如果这是不工作(因为这不是为我工作)，下面的黑客可能工作:

git rm --cached -r .
git reset --hard
git rm .gitattributes
git reset .
git checkout .

这对我很管用!

这可能发生在您执行包含文件的签出时，这些文件本应由LFS跟踪(如.gitattributes中指定的那样)，但它们却被直接提交了。大多数情况下，您有另一个程序管理您的存储库，如git GUI或IDE。

这可能会令人沮丧，因为这些文件不知从哪里冒出来，阻止您进行签出。只要您将更改隐藏起来，它们就会返回!如果您陷入这种情况，一个快速的解决方法是在一个临时分支上提交这些更改，这样您就可以再次签出。

要真正解决这个问题，请确保将文件提交为LFS指针。这应该和使用git add一样简单。在提交之前使用git lfs状态检查你的工作。git lfs ls-files将显示lfs正在管理的文件。

git lfs状态是误导性的，因为当它真正列出所有更改时，它会读取git lfs对象以提交。您希望由LFS跟踪的文件应该读取类似于(LFS: c9e4f4a)或(Git: c9e4f4a -> LFS: c9e4f4a)的文件，而不是(Git: c9e4f4a)。

举例来说，我发现这是一个问题，当通过Xcode 9.2添加图像资产时，我添加了“CalendarChecked.png”，它会自动添加:

$ git status
Changes to be committed:
  (use "git reset HEAD <file>..." to unstage)

    new file:   Example/Assets.xcassets/CalendarChecked.imageset/CalendarChecked.png

Changes not staged for commit:
  (use "git add <file>..." to update what will be committed)
  (use "git checkout -- <file>..." to discard changes in working directory)

    modified:   Example/Assets.xcassets/CalendarChecked.imageset/CalendarChecked.png

$ git lfs status

Git LFS objects to be committed:

    Example/Assets.xcassets/CalendarChecked.imageset/CalendarChecked.png (Git: c9e4f4a)

Git LFS objects not staged for commit:

    Example/Assets.xcassets/CalendarChecked.imageset/CalendarChecked.png (File: c9e4f4a)

$ git add Example/Assets.xcassets/CalendarChecked.imageset/CalendarChecked.png`
$ git lfs status

Git LFS objects to be committed:

    Empty/Empty/Assets.xcassets/CalendarChecked.imageset/CalendarChecked.png (LFS: c9e4f4a)

Git LFS objects not staged for commit:

$

在我的例子中，它是一个lfs规则下的文件(我假设它是在没有安装lfs或其他东西的情况下检入的)。

所以我在.gitattributes文件中找到了它的扩展名，并将这一行注释为

#*.7z filter=lfs diff=lfs merge=lfs -text

保存这个.git属性，然后git状态显示没有问题。

之后，我取消了这一行的注释(删除了#)，保存了.gitattributes和git状态仍然显示没有问题。

这只是再次显示什么一堆狗**** GIT-LFS。

你可能会遇到这种情况，如果:

文件包含在common-base-branch中，而不是LFS中 在基于common-base-branch的分支LFS -branch中，文件被移动到LFS 在另一个同样基于common-base-branch的非lfs-branch分支中，修改了文件。

或者:

文件不包含在common-base-branch中 在基于common-base-branch的分支LFS -branch中，文件被添加到LFS 在另一个同样基于common-base-branch的非LFS -branch分支中，文件被添加(但不是添加到LFS。

在这两种情况下，当您尝试将非lfs-branch合并到lfs-branch时，都会得到这种错误。

您可能会问，为什么会出现这种情况，但答案是，许多软件是由不止一个人开发的(这就是为什么会有像GIT这样的版本控制系统)，而且人们并不总是彼此交谈，或者LFS是后来在一个特性分支的项目历史中引入的，而“正常”的开发仍然在其他分支中进行。

这是一种合法的合并冲突情况，而不是错误或损坏的工作目录或任何东西(正如其他一些答案所暗示的那样)。GIT-LFS只是处理得不好。

您现在要做的是确保冲突文件的正确版本进入GIT-LFS，因此您可能想要选择这个问题的答案…(注意事项:插入至少一个有效答案的链接)

我有这个确切的错误与一些文件存储与git-LFS和解决它的方式一样，我已经解决了一个linending诱导borked索引。

清除缓存并进行硬复位:

git rm --cached -r .
git reset --hard

对于我来说，这比一个新鲜的克隆要快得多，因为我的repo中有巨大的git-LFS文件。

接受的答案为我工作，但它只会在我手动输入命令时工作，我把每个命令之间的睡眠，现在它作为一个bash脚本工作:

git rm --cached -r .
sleep 1
git reset --hard
sleep 1
git rm .gitattributes
sleep 1
git reset .
sleep 1
git checkout .