对我来说，罪魁祸首是windows安全，它阻止了git.exe运行，你可以检查屏幕右下角的通知选项卡。

消息将如下所示

Virus and threat protection 
unauthorized changes blocked
controlled folder access blocked git.exe from running

我在Windows上的TortoiseGit和Cygwin有这个问题。我不能删除。/.git/index。我尝试了Cygwin和命令提示符，它说该文件正在被另一个进程使用。

我发现我有两个TortoiseProc.exe实例正在运行。我杀死了其中一个，并关闭了我所有的windows资源管理器窗口，然后能够删除文件。我不知道杀死一个TortoiseProc.exe实例是解决方案还是关闭windows资源管理器窗口。

这可能是一个旧的回答，但我希望这对下一个需要这个解决方案的人更有用。

在linux/unix/gitbash/cygwin上尝试

Rm -f .git/index.lock

在Windows命令提示符中尝试:

.git \ index.lock的

除非你真的打算让根用户拥有你的repo，否则这听起来像是你意外地以根用户身份运行了Git命令(甚至可能是初始的clone/init)。如果您打算这样做，那么您将不得不以根用户身份在repo中运行所有Git命令。如果没有，运行sudo chown your-user[:your-group] -R .git来获得它的所有权，然后看看事情是否正常。

对我有帮助的是:

Git rebase -中止并重新启动rebase。

正如Andrew提到的，当这种情况发生时，我也在使用PHPStorm。不过也没必要关闭。

在任务管理器中:

开发所有流程 关闭所有git进程 删除锁定文件