我在localhost中使用MySQL作为在R中执行统计的“查询工具”，也就是说，每次我运行R脚本时，我都会创建一个新的数据库(a)，创建一个新的表(B)，将数据导入到B中，提交一个查询以获得我需要的数据，然后我删除B和删除a。
这对我来说很好，但我意识到ibdata文件的大小正在迅速增加，我在MySQL中没有存储任何东西，但ibdata1文件已经超过100 MB。
我正在使用或多或少的默认MySQL设置进行设置，是否有一种方法可以让我在一段固定的时间后自动收缩/清除ibdata1文件?
当前回答
快速脚本接受的答案的过程在bash:
#!/usr/bin/env bash
dbs=$(mysql -BNe 'show databases' | grep -vE '^mysql$|^(performance|information)_schema$')
mysqldump --events --triggers --databases $dbs > alldatabases.sql && \
echo "$dbs" | while read -r db; do
mysqladmin drop "$db"
done && \
mysql -e 'SET GLOBAL innodb_fast_shutdown = 0' && \
/etc/init.d/mysql stop && \
rm -f /var/lib/mysql/ib{data1,_logfile*} && \
/etc/init.d/mysql start && \
mysql < alldatabases.sql
保存为purge_binlogs.sh并以root用户运行。
不包括mysql, information_schema, performance_schema(和binlog目录)。
假设您在/root/.my.cnf中有管理员凭证，并且您的数据库位于默认的/var/lib/mysql目录中。
您也可以在运行此脚本后清除二进制日志，以重新获得更多的磁盘空间:
PURGE BINARY LOGS BEFORE CURRENT_TIMESTAMP;
其他回答
再加上约翰P的回答，
对于linux系统，步骤1-6可以用这些命令完成:
Mysqldump -u [username] -p[root_password] [database_name] > dumpfilename.sql Mysqladmin -u [username] -p[root_password] drop [database_name] sudo /etc/init.d / mysqld停止 Sudo rm /var/lib/mysql/ibdata1 执行rm /var/lib/mysql/ib_logfile* sudo /etc/init.d / mysqld开始 Mysqladmin -u [username] -p[root_password] create [database_name] Mysql -u [username] -p[root_password] [database_name] < dumpfilename.sql . zip
警告:如果你在这个mysql实例上有其他数据库，这些指令将导致你丢失其他数据库。确保修改步骤1、2和6、7以覆盖您希望保留的所有数据库。
在新版的mysql服务器菜谱上面会粉碎“mysql”数据库。 在旧版本中，它是有效的。在new中，一些表切换到INNODB类型，这样做会损坏它们。 最简单的方法是:
转储所有数据库 卸载mysql服务器, 添加remain my.cnf:
[mysqld]
innodb_file_per_table=1
删除/var/lib/mysql中的所有文件 安装mysql服务器 恢复用户和数据库
快速脚本接受的答案的过程在bash:
#!/usr/bin/env bash
dbs=$(mysql -BNe 'show databases' | grep -vE '^mysql$|^(performance|information)_schema$')
mysqldump --events --triggers --databases $dbs > alldatabases.sql && \
echo "$dbs" | while read -r db; do
mysqladmin drop "$db"
done && \
mysql -e 'SET GLOBAL innodb_fast_shutdown = 0' && \
/etc/init.d/mysql stop && \
rm -f /var/lib/mysql/ib{data1,_logfile*} && \
/etc/init.d/mysql start && \
mysql < alldatabases.sql
保存为purge_binlogs.sh并以root用户运行。
不包括mysql, information_schema, performance_schema(和binlog目录)。
假设您在/root/.my.cnf中有管理员凭证，并且您的数据库位于默认的/var/lib/mysql目录中。
您也可以在运行此脚本后清除二进制日志，以重新获得更多的磁盘空间:
PURGE BINARY LOGS BEFORE CURRENT_TIMESTAMP;
如果您的目标是监视MySQL的空闲空间，而您又不能停止MySQL来缩小ibdata文件，那么可以通过表状态命令来获取它。例子:
MySQL > 5.1.24:
mysqlshow --status myInnodbDatabase myTable | awk '{print $20}'
MySQL < 5.1.24:
mysqlshow --status myInnodbDatabase myTable | awk '{print $35}'
然后将这个值与ibdata文件进行比较:
du -b ibdata1
来源:http://dev.mysql.com/doc/refman/5.1/en/show-table-status.html
当你删除innodb表时，MySQL不会释放ibdata文件中的空间，这就是为什么它一直在增长。这些文件几乎从不缩小。
如何缩小现有的ibdata文件:
https://dev.mysql.com/doc/refman/5.6/en/innodb-system-tablespace.html#innodb-resize-system-tablespace
您可以编写脚本，并安排脚本在固定的时间后运行，但对于上面描述的设置，多个表空间似乎是更简单的解决方案。
如果使用配置选项innodb_file_per_table，则会创建多个表空间。也就是说，MySQL为每个表创建单独的文件，而不是一个共享文件。这些单独的文件存储在数据库的目录中，当您删除该数据库时，它们将被删除。在您的情况下，这样就不需要收缩/清除ibdata文件了。
关于多个表空间的更多信息:
https://dev.mysql.com/doc/refman/5.6/en/innodb-file-per-table-tablespaces.html
