谁能给我解释一下Numpy中网格函数的目的是什么?我知道它创建了某种用于绘图的坐标网格,但我真的看不到它的直接好处。

我正在学习Sebastian Raschka的“Python机器学习”,他正在用它来绘制决策边界。请看这里的输入11。

我也从官方文档中尝试了这段代码,但是,同样,输出对我来说没有意义。

x = np.arange(-5, 5, 1)
y = np.arange(-5, 5, 1)
xx, yy = np.meshgrid(x, y, sparse=True)
z = np.sin(xx**2 + yy**2) / (xx**2 + yy**2)
h = plt.contourf(x,y,z)

如果可能的话,请给我展示一些真实的例子。


当前回答

基本思想

给定可能的x值xs(可以把它们看作是图形x轴上的标记)和可能的y值ys, meshgrid生成相应的(x, y)网格点集——类似于set((x, y) for x in xs for y in yx)。例如,如果x =(1、2、3),y =(4、5、6),我们会得到一组坐标{(1,4)(2、4),(3、4),(1、5),(2、5),(3、5),(6),(2,6),(6)}。

返回值的形式

但是,meshgrid返回的表示与上面的表达式有两个不同之处:

首先,meshgrid在2d数组中布局网格点:行对应不同的y值,列对应不同的x值——如list(list((x, y) for x in xs) for y in ys),这将给出以下数组:

   [[(1,4), (2,4), (3,4)],
    [(1,5), (2,5), (3,5)],
    [(1,6), (2,6), (3,6)]]

其次,meshgrid分别返回x和y坐标(即在两个不同的numpy 2d数组中):

   xcoords, ycoords = (
       array([[1, 2, 3],
              [1, 2, 3],
              [1, 2, 3]]),
       array([[4, 4, 4],
              [5, 5, 5],
              [6, 6, 6]]))
   # same thing using np.meshgrid:
   xcoords, ycoords = np.meshgrid([1,2,3], [4,5,6])
   # same thing without meshgrid:
   xcoords = np.array([xs] * len(ys)
   ycoords = np.array([ys] * len(xs)).T

注意,np。Meshgrid还可以生成更高维度的网格。给定xs ys和zs,你会得到xcods ycods zcods作为3d数组。网格还支持维度的反向排序以及结果的稀疏表示。

应用程序

为什么我们需要这种形式的输出?

在网格的每个点上应用一个函数: 一个动机是二进制操作符(+,-,*,/,**)作为元素级操作符重载numpy数组。这意味着如果我有一个函数def f(x, y): return (x - y) ** 2,它在两个标量上工作,我也可以将它应用在两个numpy数组上,以获得一个elementwise结果的数组:例如f(xcoordinates, ycoords)或f(*np。Meshgrid (xs, ys))在上面的例子中给出了以下内容:

array([[ 9,  4,  1],
       [16,  9,  4],
       [25, 16,  9]])

高维外积:我不确定这有多有效,但你可以这样得到高维外积:np.prod(np. prod)Meshgrid([1,2,3],[1,2],[1,2,3,4]),轴=0)。

matplotlib中的等高线图:在研究用matplotlib绘制等高线图以绘制决策边界时,我遇到了网格。为此,你用meshgrid生成一个网格,计算每个网格点的函数(如上图所示),然后将xcods, ycods和计算的f值(即zcods)传递到contourf函数中。

其他回答

假设你有一个函数:

def sinus2d(x, y):
    return np.sin(x) + np.sin(y)

比如说,你想看看它在0到2*范围内是什么样子。你会怎么做?np。Meshgrid进来了:

xx, yy = np.meshgrid(np.linspace(0,2*np.pi,100), np.linspace(0,2*np.pi,100))
z = sinus2d(xx, yy) # Create the image on this grid

这样的图是这样的:

import matplotlib.pyplot as plt
plt.imshow(z, origin='lower', interpolation='none')
plt.show()

所以np。网格只是一种方便。原则上,同样可以通过以下方法做到:

z2 = sinus2d(np.linspace(0,2*np.pi,100)[:,None], np.linspace(0,2*np.pi,100)[None,:])

但是您需要注意您的维度(假设您有两个以上…)和正确的广播。np。Meshgrid为您完成了所有这些。

此外,如果你想做插值,但排除某些值,meshgrid允许你删除坐标和数据:

condition = z>0.6
z_new = z[condition] # This will make your array 1D

现在怎么做插值呢?你可以把x和y赋给一个插值函数,比如scipy. interpolation .interp2d,所以你需要一种方法来知道哪些坐标被删除了:

x_new = xx[condition]
y_new = yy[condition]

然后你仍然可以插入“正确的”坐标(尝试没有网格,你会有很多额外的代码):

from scipy.interpolate import interp2d
interpolated = interp2d(x_new, y_new, z_new)

原始网格允许你再次得到原始网格上的插值:

interpolated_grid = interpolated(xx[0], yy[:, 0]).reshape(xx.shape)

这些只是我使用网格的一些例子,可能还有更多。

幕后故事:

import numpy as np

def meshgrid(x , y):
    XX = []
    YY = []
    for colm in range(len(y)):
        XX.append([])
        YY.append([])
        for row in range(len(x)):
            XX[colm].append(x[row])
            YY[colm].append(y[colm])
    return np.asarray(XX), np.asarray(YY)

让我们以@Sarsaparilla的答案为例:

y = [7, 6, 5]
x = [1, 2, 3, 4]

xx, yy = meshgrid(x , y)

输出:

>>> xx
array([[1, 2, 3, 4],
       [1, 2, 3, 4],
       [1, 2, 3, 4]])

>>> yy
array([[7, 7, 7, 7],
       [6, 6, 6, 6],
       [5, 5, 5, 5]])

meshgrid的目的是用x值数组和y值数组创建一个矩形网格。

例如,如果我们想创建一个网格在x和y方向上的0到4之间的每一个整数值上都有一个点。为了创建一个矩形网格,我们需要x和y点的每个组合。

这是25点,对吧?如果我们想为所有这些点创建一个x和y数组,我们可以这样做。

x[0,0] = 0    y[0,0] = 0
x[0,1] = 1    y[0,1] = 0
x[0,2] = 2    y[0,2] = 0
x[0,3] = 3    y[0,3] = 0
x[0,4] = 4    y[0,4] = 0
x[1,0] = 0    y[1,0] = 1
x[1,1] = 1    y[1,1] = 1
...
x[4,3] = 3    y[4,3] = 4
x[4,4] = 4    y[4,4] = 4

这将导致以下x和y矩阵,这样每个矩阵中相应元素的配对就给出了网格中一点的x和y坐标。

x =   0 1 2 3 4        y =   0 0 0 0 0
      0 1 2 3 4              1 1 1 1 1
      0 1 2 3 4              2 2 2 2 2
      0 1 2 3 4              3 3 3 3 3
      0 1 2 3 4              4 4 4 4 4

然后我们可以绘制它们来验证它们是否是一个网格:

plt.plot(x,y, marker='.', color='k', linestyle='none')

显然,这是非常乏味的,特别是对于大范围的x和y。相反,meshgrid实际上可以为我们生成这个:我们所需要指定的是唯一的x和y值。

xvalues = np.array([0, 1, 2, 3, 4]);
yvalues = np.array([0, 1, 2, 3, 4]);

现在,当我们调用meshgrid时,我们会自动获得之前的输出。

xx, yy = np.meshgrid(xvalues, yvalues)

plt.plot(xx, yy, marker='.', color='k', linestyle='none')

创建这些矩形网格对许多任务都很有用。在你的文章中提供的例子中,它只是一种在x和y的值范围内采样函数(sin(x**2 + y**2) / (x**2 + y**2))的方法。

由于该函数已在矩形网格上进行采样,因此现在可以将该函数可视化为“图像”。

此外,结果现在可以传递给函数,期望数据在矩形网格(即轮廓)

微软Excel提供:

实际上np的目的。在文档中已经提到了Meshgrid:

np.meshgrid 从坐标向量返回坐标矩阵。 在给定一维坐标数组x1, x2,…, xn。

它的主要目的是创建一个坐标矩阵。

你可能会问自己:

为什么我们需要创建坐标矩阵?

你需要使用Python/NumPy坐标矩阵的原因是,坐标和值之间没有直接关系,除非你的坐标从0开始并且是纯正整数。然后你可以使用数组的下标作为下标。 然而,当情况并非如此时,您需要以某种方式将坐标存储在数据旁边。这就是网格的用武之地。

假设你的数据是:

1  2  1
2  5  2
1  2  1

但是,每个值代表3 x 2公里的面积(水平x垂直)。假设你的原点是左上角,你想用数组来表示你可以使用的距离:

import numpy as np
h, v = np.meshgrid(np.arange(3)*3, np.arange(3)*2)

其中v为:

array([[0, 0, 0],
       [2, 2, 2],
       [4, 4, 4]])

和h:

array([[0, 3, 6],
       [0, 3, 6],
       [0, 3, 6]])

所以如果你有两个指标,比如说x和y(这就是为什么网格的返回值通常是xx或xs而不是x,在这种情况下,我选择h表示水平!),那么你可以得到点的x坐标,点的y坐标和该点的值,通过使用:

h[x, y]    # horizontal coordinate
v[x, y]    # vertical coordinate
data[x, y]  # value

这使得跟踪坐标变得更加容易,(更重要的是)您可以将它们传递给需要知道坐标的函数。

稍微长一点的解释

However, np.meshgrid itself isn't often used directly, mostly one just uses one of similar objects np.mgrid or np.ogrid. Here np.mgrid represents the sparse=False and np.ogrid the sparse=True case (I refer to the sparse argument of np.meshgrid). Note that there is a significant difference between np.meshgrid and np.ogrid and np.mgrid: The first two returned values (if there are two or more) are reversed. Often this doesn't matter but you should give meaningful variable names depending on the context.

例如,对于2D网格和matplotlib.pyplot.imshow,将np的第一个返回项命名是有意义的。x和y的网格 np也一样。Mgrid和np. grid。

np。网格和稀疏网格

>>> import numpy as np
>>> yy, xx = np.ogrid[-5:6, -5:6]
>>> xx
array([[-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5]])
>>> yy
array([[-5],
       [-4],
       [-3],
       [-2],
       [-1],
       [ 0],
       [ 1],
       [ 2],
       [ 3],
       [ 4],
       [ 5]])
       

如前所述,输出与np相比是相反的。meshgrid,这就是为什么我解包为yy, xx而不是xx, yy:

>>> xx, yy = np.meshgrid(np.arange(-5, 6), np.arange(-5, 6), sparse=True)
>>> xx
array([[-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5]])
>>> yy
array([[-5],
       [-4],
       [-3],
       [-2],
       [-1],
       [ 0],
       [ 1],
       [ 2],
       [ 3],
       [ 4],
       [ 5]])

这已经看起来像坐标了,特别是2D图中的x和y线。

可视化:

yy, xx = np.ogrid[-5:6, -5:6]
plt.figure()
plt.title('ogrid (sparse meshgrid)')
plt.grid()
plt.xticks(xx.ravel())
plt.yticks(yy.ravel())
plt.scatter(xx, np.zeros_like(xx), color="blue", marker="*")
plt.scatter(np.zeros_like(yy), yy, color="red", marker="x")

np。Mgrid和密集/丰满的网格

>>> yy, xx = np.mgrid[-5:6, -5:6]
>>> xx
array([[-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5],
       [-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5],
       [-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5],
       [-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5],
       [-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5],
       [-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5],
       [-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5],
       [-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5],
       [-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5],
       [-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5],
       [-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5]])
>>> yy
array([[-5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5],
       [-4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4],
       [-3, -3, -3, -3, -3, -3, -3, -3, -3, -3, -3],
       [-2, -2, -2, -2, -2, -2, -2, -2, -2, -2, -2],
       [-1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1],
       [ 0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0],
       [ 1,  1,  1,  1,  1,  1,  1,  1,  1,  1,  1],
       [ 2,  2,  2,  2,  2,  2,  2,  2,  2,  2,  2],
       [ 3,  3,  3,  3,  3,  3,  3,  3,  3,  3,  3],
       [ 4,  4,  4,  4,  4,  4,  4,  4,  4,  4,  4],
       [ 5,  5,  5,  5,  5,  5,  5,  5,  5,  5,  5]])
       

这里也一样:输出与np.meshgrid相反:

>>> xx, yy = np.meshgrid(np.arange(-5, 6), np.arange(-5, 6))
>>> xx
array([[-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5],
       [-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5],
       [-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5],
       [-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5],
       [-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5],
       [-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5],
       [-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5],
       [-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5],
       [-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5],
       [-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5],
       [-5, -4, -3, -2, -1,  0,  1,  2,  3,  4,  5]])
>>> yy
array([[-5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5],
       [-4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4],
       [-3, -3, -3, -3, -3, -3, -3, -3, -3, -3, -3],
       [-2, -2, -2, -2, -2, -2, -2, -2, -2, -2, -2],
       [-1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1],
       [ 0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0],
       [ 1,  1,  1,  1,  1,  1,  1,  1,  1,  1,  1],
       [ 2,  2,  2,  2,  2,  2,  2,  2,  2,  2,  2],
       [ 3,  3,  3,  3,  3,  3,  3,  3,  3,  3,  3],
       [ 4,  4,  4,  4,  4,  4,  4,  4,  4,  4,  4],
       [ 5,  5,  5,  5,  5,  5,  5,  5,  5,  5,  5]])
       

与网格不同,这些数组包含-5 <= xx <= 5中的所有xx和yy坐标;-5 <= yy <= 5格。

yy, xx = np.mgrid[-5:6, -5:6]
plt.figure()
plt.title('mgrid (dense meshgrid)')
plt.grid()
plt.xticks(xx[0])
plt.yticks(yy[:, 0])
plt.scatter(xx, yy, color="red", marker="x")

功能

它不仅限于2D,这些函数适用于任意维度(好吧,Python中给函数的参数有最大数量,NumPy允许的最大维度数量):

>>> x1, x2, x3, x4 = np.ogrid[:3, 1:4, 2:5, 3:6]
>>> for i, x in enumerate([x1, x2, x3, x4]):
...     print('x{}'.format(i+1))
...     print(repr(x))
x1
array([[[[0]]],


       [[[1]]],


       [[[2]]]])
x2
array([[[[1]],

        [[2]],

        [[3]]]])
x3
array([[[[2],
         [3],
         [4]]]])
x4
array([[[[3, 4, 5]]]])

>>> # equivalent meshgrid output, note how the first two arguments are reversed and the unpacking
>>> x2, x1, x3, x4 = np.meshgrid(np.arange(1,4), np.arange(3), np.arange(2, 5), np.arange(3, 6), sparse=True)
>>> for i, x in enumerate([x1, x2, x3, x4]):
...     print('x{}'.format(i+1))
...     print(repr(x))
# Identical output so it's omitted here.

即使这些也适用于1D,还有两个(更常见的)1D网格创建函数:

np.arange np.linspace

除了start和stop参数,它还支持step参数(甚至是表示步数的复杂steps):

>>> x1, x2 = np.mgrid[1:10:2, 1:10:4j]
>>> x1  # The dimension with the explicit step width of 2
array([[1., 1., 1., 1.],
       [3., 3., 3., 3.],
       [5., 5., 5., 5.],
       [7., 7., 7., 7.],
       [9., 9., 9., 9.]])
>>> x2  # The dimension with the "number of steps"
array([[ 1.,  4.,  7., 10.],
       [ 1.,  4.,  7., 10.],
       [ 1.,  4.,  7., 10.],
       [ 1.,  4.,  7., 10.],
       [ 1.,  4.,  7., 10.]])
       

应用程序

你特别问了目的,事实上,如果你需要一个坐标系统,这些网格是非常有用的。

例如,如果你有一个计算二维距离的NumPy函数:

def distance_2d(x_point, y_point, x, y):
    return np.hypot(x-x_point, y-y_point)
    

你想知道每个点的距离

>>> ys, xs = np.ogrid[-5:5, -5:5]
>>> distances = distance_2d(1, 2, xs, ys)  # distance to point (1, 2)
>>> distances
array([[9.21954446, 8.60232527, 8.06225775, 7.61577311, 7.28010989,
        7.07106781, 7.        , 7.07106781, 7.28010989, 7.61577311],
       [8.48528137, 7.81024968, 7.21110255, 6.70820393, 6.32455532,
        6.08276253, 6.        , 6.08276253, 6.32455532, 6.70820393],
       [7.81024968, 7.07106781, 6.40312424, 5.83095189, 5.38516481,
        5.09901951, 5.        , 5.09901951, 5.38516481, 5.83095189],
       [7.21110255, 6.40312424, 5.65685425, 5.        , 4.47213595,
        4.12310563, 4.        , 4.12310563, 4.47213595, 5.        ],
       [6.70820393, 5.83095189, 5.        , 4.24264069, 3.60555128,
        3.16227766, 3.        , 3.16227766, 3.60555128, 4.24264069],
       [6.32455532, 5.38516481, 4.47213595, 3.60555128, 2.82842712,
        2.23606798, 2.        , 2.23606798, 2.82842712, 3.60555128],
       [6.08276253, 5.09901951, 4.12310563, 3.16227766, 2.23606798,
        1.41421356, 1.        , 1.41421356, 2.23606798, 3.16227766],
       [6.        , 5.        , 4.        , 3.        , 2.        ,
        1.        , 0.        , 1.        , 2.        , 3.        ],
       [6.08276253, 5.09901951, 4.12310563, 3.16227766, 2.23606798,
        1.41421356, 1.        , 1.41421356, 2.23606798, 3.16227766],
       [6.32455532, 5.38516481, 4.47213595, 3.60555128, 2.82842712,
        2.23606798, 2.        , 2.23606798, 2.82842712, 3.60555128]])
        

如果在密集网格而不是开放网格中通过,输出将是相同的。NumPys广播使之成为可能!

让我们将结果可视化:

plt.figure()
plt.title('distance to point (1, 2)')
plt.imshow(distances, origin='lower', interpolation="none")
plt.xticks(np.arange(xs.shape[1]), xs.ravel())  # need to set the ticks manually
plt.yticks(np.arange(ys.shape[0]), ys.ravel())
plt.colorbar()

这也是NumPys mgrid和ogrid变得非常方便的时候,因为它允许您轻松地更改网格的分辨率:

ys, xs = np.ogrid[-5:5:200j, -5:5:200j]
# otherwise same code as above

但是,由于imshow不支持x和y输入,因此必须手动更改刻度。如果它能接受x和y坐标就很方便了,对吧?

使用NumPy编写自然处理网格的函数很容易。此外,NumPy、SciPy和matplotlib中有几个函数希望您在网格中传递。

我喜欢图像,所以让我们探索matplotlib.pyplot.contour:

ys, xs = np.mgrid[-5:5:200j, -5:5:200j]
density = np.sin(ys)-np.cos(xs)
plt.figure()
plt.contour(xs, ys, density)

注意,坐标已经正确设置!如果你只传递密度就不是这样了。

或者再举一个使用星相模型的有趣例子(这次我不太关心坐标,我只是用它们来创建一些网格):

from astropy.modeling import models
z = np.zeros((100, 100))
y, x = np.mgrid[0:100, 0:100]
for _ in range(10):
    g2d = models.Gaussian2D(amplitude=100, 
                           x_mean=np.random.randint(0, 100), 
                           y_mean=np.random.randint(0, 100), 
                           x_stddev=3, 
                           y_stddev=3)
    z += g2d(x, y)
    a2d = models.AiryDisk2D(amplitude=70, 
                            x_0=np.random.randint(0, 100), 
                            y_0=np.random.randint(0, 100), 
                            radius=5)
    z += a2d(x, y)
    

虽然这只是“为了看起来”,但与函数模型和拟合相关的几个函数(例如scipy. interpolite .interp2d, Scipy .interpolate.griddata甚至显示使用np.mgrid)的例子,在Scipy等需要网格。其中大多数都使用开放网格和密集网格,但有些只使用其中一种。