这是Eclipse中的一个bug。我也遇到了同样的问题，也是在Ubuntu上使用Eclipse Java EE Juno。

以下是对我有效的变通方法:

关闭Eclipse 在{workspace-directory}/.metadata/.plugins/org.eclipse.core.runtime/.settings中删除以下两个文件: org.eclipse.wst.server.core.prefs org.eclipse.jst.server.tomcat.core.prefs 重新启动Eclipse

来源:eclipse.org论坛

很奇怪，但这对我很管用。

关闭eclipse 以eclipse启动eclipse，干净

在我的例子中，tomcat目录由root拥有，我没有以root身份运行eclipse。

所以我不得不

sudo chown -R  $USER apache-tomcat-VERSION/

我也遇到了同样的问题，我把工作空间换到了新的位置，它工作了。 我希望这对你有所帮助:)

在尝试@Philipp cl ßen步骤后，即使没有工作，

更改eclipse、workspace和tomcat目录。[只测试Windows7]

我知道有人可能会说这不正确， 但在@菲利普的步骤对我不起作用后，这对我起作用了。

我花了4个小时才找到这个蛮力方法。

我在ubuntu中运行开普勒，在让eclipse识别tomcat7服务器时遇到了同样的问题。我的安装目录的路径是好的，删除/重命名文件也没有修复它。

这对我来说很管用:

在terminal中执行如下命令:

cd ~/workspace/.metadata/.plugins/org.eclipse.core.runtime/.settings/    
rm org.eclipse.jst.server.tomcat.core.prefs    
rm org.eclipse.wst.server.core.prefs
cd /usr/share/tomcat7
sudo service tomcat7 stop
sudo update-rc.d tomcat7 disable
sudo ln -s /var/lib/tomcat7/conf conf
sudo ln -s /etc/tomcat7/policy.d/03catalina.policy conf/catalina.policy
sudo ln -s /var/log/tomcat7 log
sudo chmod -R 777 /usr/share/tomcat7/conf
sudo ln -s /var/lib/tomcat7/common common
sudo ln -s /var/lib/tomcat7/server server
sudo ln -s /var/lib/tomcat7/shared shared

重启eclipse，删除tomcat7服务器。重新添加服务器，然后一切正常工作。

这是我使用的链接。 http://linux.mjnet.eu/post/1319/tomcat-7-ubuntu-13-04-and-eclipse-kepler-problem-to-run/