我也面临着同样的问题

remote: Repository not found
fatal: repository 'https://github.com/MyRepo/project.git/' not found

我卸载了git凭证管理器并重新安装了它，然后我就可以很容易地将它拉到存储库中。下面是命令

$ git credential-manager uninstall

$ git credential-manager install

我看到了这个致命的问题:当人们尝试在免费层上从私人GitHub帐户中推拉时，存储库现在更经常地发现错误。以下是最常见的解决方案:

您没有验证 您的密码已更改 你不是合作者 不正确的大小写或拼错的单词 已删除git存储库

Windows凭证管理器?

有时Windows凭证管理器会缓存你的u/p，并在幕后传递它。如果您最近更改了密码，或者使用了不同的用户名，您可能需要进入凭据管理器并清除GitHub的现有条目。

如果你正在使用Git桌面应用程序，那么你应该尝试从Git桌面应用程序中推和拉，而不是终端。它会帮助你的。

如果您正在使用访问密钥，请在创建访问密钥时给予适当的权限(我尝试了所有权限，它可以工作)

如果回购是私有的，请确保您已接受回购邀请。如果回购是私有的，而不接受回购邀请，如果你直接推送更改，它会给出相同的错误。

从系统中删除所有github.com凭据详细信息。

对于mac

从Keychain Access中删除github.com密码。

对于windows

从凭证管理器中删除凭证。