谢谢@muhqu的精彩回答。在我的例子中，并不是所有的更改文件都更改了权限，这阻止了命令的工作。

$ git diff -p -R --no-ext-diff --no-color | grep -E "^(diff|(old|new) mode)" --color=never
diff --git b/file1 a/file1
diff --git b/file2 a/file2
old mode 100755
new mode 100644
$ git diff -p -R --no-ext-diff --no-color | grep -E "^(diff|(old|new) mode)" --color=never | git apply
warning: file1 has type 100644, expected 100755

然后补丁将停止，文件将保持不变。

如果有人有类似的问题，我通过调整命令来解决这个问题，只有权限更改文件:

grep -E "^old mode (100644|100755)" -B1 -A1

或者git别名

git config --global --add alias.permission-reset '!git diff -p -R --no-ext-diff --no-color | grep -E "^old mode (100644|100755)" -B1 -A1 --color=never | git apply'

git diff -p \
| grep -E '^(diff|old mode|new mode)' \
| sed -e 's/^old/NEW/;s/^new/old/;s/^NEW/new/' \
| git apply

将工作在大多数情况下，但如果你有外部差异工具，如meld安装，你必须添加-no-ext-diff

git diff --no-ext-diff -p \
    | grep -E '^(diff|old mode|new mode)' \
    | sed -e 's/^old/NEW/;s/^new/old/;s/^NEW/new/' \
    | git apply

在我的情况下需要什么

Git不存储除可执行脚本以外的文件权限。考虑使用git-cache-meta之类的工具来保存文件所有权和权限。

Git只能存储两种模式:755(可执行)和644(不可执行)。如果你的文件是444,git会存储它的644。

etckeeper工具可以处理权限和:

etckeeper init -d /mydir

你可以把它用在其他地方，而不是/等等。

使用你的包管理器安装或从上面的链接获取源代码。

谢谢@muhqu的精彩回答。在我的例子中，并不是所有的更改文件都更改了权限，这阻止了命令的工作。

$ git diff -p -R --no-ext-diff --no-color | grep -E "^(diff|(old|new) mode)" --color=never
diff --git b/file1 a/file1
diff --git b/file2 a/file2
old mode 100755
new mode 100644
$ git diff -p -R --no-ext-diff --no-color | grep -E "^(diff|(old|new) mode)" --color=never | git apply
warning: file1 has type 100644, expected 100755

然后补丁将停止，文件将保持不变。

如果有人有类似的问题，我通过调整命令来解决这个问题，只有权限更改文件:

grep -E "^old mode (100644|100755)" -B1 -A1

或者git别名

git config --global --add alias.permission-reset '!git diff -p -R --no-ext-diff --no-color | grep -E "^old mode (100644|100755)" -B1 -A1 --color=never | git apply'

最简单的方法就是把权限改回来。正如@kroger指出的，git只跟踪可执行位。所以你可能只需要运行chmod -x文件名来修复它(或者如果需要的话+x)。