激活MySQL general.log(磁盘密集型)并使用mysql_analyse_general_log.pl来提取长时间运行的事务，例如:

——min-duration=你的innodb_lock_wait_timeout值

然后禁用general.log。

这个异常的最大问题是，它通常在测试环境中不可重现，当它发生在prod上时，我们无法运行innodb引擎状态。所以在其中一个项目中，我把下面的代码放入了这个异常的catch块中。这帮助我在异常发生时捕捉引擎状态。这帮了大忙。

Statement st = con.createStatement();
ResultSet rs =  st.executeQuery("SHOW ENGINE INNODB STATUS");
while(rs.next()){
    log.info(rs.getString(1));
    log.info(rs.getString(2));
    log.info(rs.getString(3));
}

争用越多，出现死锁的可能性就越大，DB引擎将通过对其中一个死锁事务进行超时处理来解决这个问题。

此外，已修改(例如UPDATE或DELETE)大量条目的长时间运行的事务更有可能与其他事务产生冲突。

虽然InnoDB MVCC，你仍然可以使用FOR UPDATE子句请求显式锁。然而，与其他流行的db (Oracle, MSSQL, PostgreSQL, DB2)不同，MySQL使用REPEATABLE_READ作为默认隔离级别。

现在，您获得的锁(通过修改行或使用显式锁定)将在当前运行的事务期间保持。如果你想了解REPEATABLE_READ和READ COMMITTED在锁方面的区别，请阅读这篇Percona文章。

在REPEATABLE READ中，事务期间获得的每个锁都被持有 在事务持续时间内。 在READ COMMITTED中，不匹配扫描的锁在STATEMENT完成后被释放。 .．. 这意味着在READ COMMITTED中，其他事务可以自由地更新它们在update语句完成后无法更新的行(在REPEATABLE READ中)。

因此:隔离级别(REPEATABLE_READ, SERIALIZABLE)越严格，死锁的可能性就越大。这不是“本质上”的问题，而是一种权衡。

使用READ_COMMITTED可以获得非常好的结果，因为在使用跨越多个HTTP请求的逻辑事务时，需要防止应用程序级的丢失更新。乐观锁定方法针对即使使用SERIALIZABLE隔离级别也可能发生的丢失更新，同时通过允许使用READ_COMMITTED来减少锁争用。

你可以使用:

show full processlist

它将列出MySQL中的所有连接和连接的当前状态以及正在执行的查询。还有一个更短的变种show processlist;它显示截断的查询以及连接统计信息。

下面是我最终不得不做的事情，以找出是什么“其他查询”导致了锁定超时问题。在应用程序代码中，我们在专用于此任务的单独线程上跟踪所有挂起的数据库调用。如果任何DB调用的时间超过n秒(对我们来说是30秒)，我们记录:

-- Pending InnoDB transactions
SELECT * FROM information_schema.innodb_trx ORDER BY trx_started; 

-- Optionally, log what transaction holds what locks
SELECT * FROM information_schema.innodb_locks;

通过上述方法，我们能够精确定位锁定导致死锁的行的并发查询。在我的例子中，它们是像INSERT…与普通SELECT不同，SELECT锁定底层行。然后可以重新组织代码或使用不同的事务隔离(如read uncommitted)。

好运！

正如有人在关于这个问题的众多SO线程中的一个线程中提到的:有时已经锁定表的进程在进程列表中显示为休眠!我非常着急，直到我杀死了数据库中打开的所有睡眠线程(当时没有一个是活动的)。这最终解锁了表并让更新查询运行。

评论者说了类似于“有时MySQL线程锁定了一个表，然后在等待与MySQL无关的事情发生时进入睡眠状态。”

在重新检查了show engine innodb状态日志后(一旦我找到了负责锁的客户端)，我注意到被卡住的线程被列在事务列表的最底部，在由于锁冻结而即将出错的活动查询下面:

------------------
---TRANSACTION 2744943820, ACTIVE 1154 sec(!!)
2 lock struct(s), heap size 376, 2 row lock(s), undo log entries 1
MySQL thread id 276558, OS thread handle 0x7f93762e7710, query id 59264109 [ip] [database] cleaning up
Trx read view will not see trx with id >= 2744943821, sees < 2744943821

(不确定“Trx读视图”消息是否与冻结锁相关，但与其他活动事务不同的是，这个事务不显示与发出的查询一起，而是声称事务正在“清理”，但有多个行锁)

这个故事的寓意是，即使线程处于睡眠状态，事务也可以是活动的。