此函数将远程repo克隆到本地repo目录中，合并后将保存所有提交，git日志将显示原始提交和正确路径：

function git-add-repo
{
    repo="$1"
    dir="$(echo "$2" | sed 's/\/$//')"
    path="$(pwd)"

    tmp="$(mktemp -d)"
    remote="$(echo "$tmp" | sed 's/\///g'| sed 's/\./_/g')"

    git clone "$repo" "$tmp"
    cd "$tmp"

    git filter-branch --index-filter '
        git ls-files -s |
        sed "s,\t,&'"$dir"'/," |
        GIT_INDEX_FILE="$GIT_INDEX_FILE.new" git update-index --index-info &&
        mv "$GIT_INDEX_FILE.new" "$GIT_INDEX_FILE"
    ' HEAD

    cd "$path"
    git remote add -f "$remote" "file://$tmp/.git"
    git pull "$remote/master"
    git merge --allow-unrelated-histories -m "Merge repo $repo into master" --edit "$remote/master"
    git remote remove "$remote"
    rm -rf "$tmp"
}

如何使用：

cd current/package
git-add-repo https://github.com/example/example dir/to/save

如果进行一些更改，您甚至可以将合并的repo的文件/目录移动到不同的路径中，例如：

repo="https://github.com/example/example"
path="$(pwd)"

tmp="$(mktemp -d)"
remote="$(echo "$tmp" | sed 's/\///g' | sed 's/\./_/g')"

git clone "$repo" "$tmp"
cd "$tmp"

GIT_ADD_STORED=""

function git-mv-store
{
    from="$(echo "$1" | sed 's/\./\\./')"
    to="$(echo "$2" | sed 's/\./\\./')"

    GIT_ADD_STORED+='s,\t'"$from"',\t'"$to"',;'
}

# NOTICE! This paths used for example! Use yours instead!
git-mv-store 'public/index.php' 'public/admin.php'
git-mv-store 'public/data' 'public/x/_data'
git-mv-store 'public/.htaccess' '.htaccess'
git-mv-store 'core/config' 'config/config'
git-mv-store 'core/defines.php' 'defines/defines.php'
git-mv-store 'README.md' 'doc/README.md'
git-mv-store '.gitignore' 'unneeded/.gitignore'

git filter-branch --index-filter '
    git ls-files -s |
    sed "'"$GIT_ADD_STORED"'" |
    GIT_INDEX_FILE="$GIT_INDEX_FILE.new" git update-index --index-info &&
    mv "$GIT_INDEX_FILE.new" "$GIT_INDEX_FILE"
' HEAD

GIT_ADD_STORED=""

cd "$path"
git remote add -f "$remote" "file://$tmp/.git"
git pull "$remote/master"
git merge --allow-unrelated-histories -m "Merge repo $repo into master" --edit "$remote/master"
git remote remove "$remote"
rm -rf "$tmp"

通知路径将通过sed替换，因此请确保在合并后将其移动到正确的路径中。--allow非相关历史参数仅在git>=2.9之后存在。

给定命令是我建议的最佳解决方案。

git subtree add --prefix=MY_PROJECT git://github.com/project/my_project.git master

另一个存储库的单个分支可以很容易地放在保留其历史的子目录下。例如：

git subtree add --prefix=rails git://github.com/rails/rails.git master

这将显示为一次提交，其中Rails主分支的所有文件都添加到“Rails”目录中。然而，提交的标题包含对旧历史树的引用：

从提交添加“rails/”<rev>

其中＜rev＞是SHA-1提交哈希。你仍然可以看到历史，责怪一些变化。

git log <rev>
git blame <rev> -- README.md

注意，从这里看不到目录前缀，因为这是一个完整的旧分支。您应该像通常的文件移动提交一样对待它：当到达它时，您需要额外的跳转。

# finishes with all files added at once commit
git log rails/README.md

# then continue from original tree
git log <rev> -- README.md

还有一些更复杂的解决方案，如手动执行此操作或如其他答案所述重写历史。

git子树命令是git contrib的一部分，一些数据包管理器默认安装它（OS X Homebrew）。但除了git之外，您可能还需要自己安装它。

https://github.com/hraban/tomono作为基于脚本的解决方案的另一个例子。

我不是作者，但使用了它，它完成了任务。

一个积极的方面是，你将所有分支机构和所有历史记录纳入最终回购。对于我的repo（repo中没有重复的文件夹-实际上，它们来自tfs2git迁移），没有冲突，一切都是自动运行的。

它主要用于（参见名称）创建monoreos。

对于Windows用户：gitbash可以执行.sh文件。它带有标准的git安装。

以下是两种可能的解决方案：

子模块

要么将存储库A复制到较大项目B中的单独目录中，要么（也许更好）将存储库B克隆到项目B的子目录中。然后使用git子模块将此存储库设置为存储库B的子模块。

对于松散耦合的存储库来说，这是一个很好的解决方案，存储库a中的开发仍在继续，而开发的主要部分是a中的独立开发。另请参阅GitWiki上的SubmoduleSupport和GitSubmoduleTutorial页面。

子树合并

您可以使用子树合并策略将存储库A合并到项目B的子目录中。Markus Prinz在《子树合并与你》中描述了这一点。

git remote add -f Bproject /path/to/B
git merge -s ours --allow-unrelated-histories --no-commit Bproject/master
git read-tree --prefix=dir-B/ -u Bproject/master
git commit -m "Merge B project as our subdirectory"
git pull -s subtree Bproject master

（选项--Git>=2.9.0需要允许不相关的历史记录。）

或者你可以使用apenwarr（Avery Pennarun）的git子树工具（GitHub上的存储库），例如，在他的博客文章《git子模块的新替代方案：git子树》中宣布了这一点。

我认为在您的情况下（A是大型项目B的一部分），正确的解决方案是使用子树合并。

要在B中合并a：

1） 在项目A中

git fast-export --all --date-order > /tmp/ProjectAExport

2） 在项目B中

git checkout -b projectA
git fast-import --force < /tmp/ProjectAExport

在这个分支中，执行所有需要执行的操作并提交它们。

C） 然后回到主节点，两个分支之间进行经典合并：

git checkout master
git merge projectA