如果您想单独维护项目，子模块方法是很好的。然而，如果您真的想将两个项目合并到同一个存储库中，那么您还有更多的工作要做。

第一件事是使用gitfilter分支将第二个存储库中所有内容的名称重写到您希望它们结束的子目录中。因此，您将使用projb/foo.c和projb/bar.html代替foo.c和bar.html。

然后，您应该能够执行以下操作：

git remote add projb [wherever]
git pull projb

git pull将执行git fetch，然后执行git merge。如果您要拉到的存储库还没有projb/目录，那么应该不会有冲突。

进一步搜索表明，在将gitk合并为git时也做了类似的操作。Junio C Hamano在这里写道：http://www.mail-archive.com/git@vger.kernel.org/msg03395.html

我知道事情已经过去很久了，但我对我在这里找到的其他答案并不满意，所以我写了这样一篇文章：

me=$(basename $0)

TMP=$(mktemp -d /tmp/$me.XXXXXXXX)
echo 
echo "building new repo in $TMP"
echo
sleep 1

set -e

cd $TMP
mkdir new-repo
cd new-repo
    git init
    cd ..

x=0
while [ -n "$1" ]; do
    repo="$1"; shift
    git clone "$repo"
    dirname=$(basename $repo | sed -e 's/\s/-/g')
    if [[ $dirname =~ ^git:.*\.git$ ]]; then
        dirname=$(echo $dirname | sed s/.git$//)
    fi

    cd $dirname
        git remote rm origin
        git filter-branch --tree-filter \
            "(mkdir -p $dirname; find . -maxdepth 1 ! -name . ! -name .git ! -name $dirname -exec mv {} $dirname/ \;)"
        cd ..

    cd new-repo
        git pull --no-commit ../$dirname
        [ $x -gt 0 ] && git commit -m "merge made by $me"
        cd ..

    x=$(( x + 1 ))
done

如果要将项目a合并到项目b中：

cd path/to/project-b
git remote add project-a /path/to/project-a
git fetch project-a --tags
git merge --allow-unrelated-histories project-a/master # or whichever branch you want to merge
git remote remove project-a

摘自：git合并不同的存储库？

这种方法对我来说效果很好，它更短，在我看来更干净。

如果您想将project-a放到子目录中，可以使用gitfilter repo（不建议使用过滤器分支）。在上述命令之前运行以下命令：

cd path/to/project-a
git filter-repo --to-subdirectory-filter project-a

合并两个大型存储库，将其中一个放在子目录中的示例：https://gist.github.com/x-yuri/9890ab1079cf4357d6f269d073fd9731

注意：--allow非相关历史参数仅在git>=2.9之后存在。请参阅Git-Git merge文档/-允许不相关的历史记录

更新：按照@jstadler的建议添加了--tags，以便保留标签。

https://github.com/hraban/tomono作为基于脚本的解决方案的另一个例子。

我不是作者，但使用了它，它完成了任务。

一个积极的方面是，你将所有分支机构和所有历史记录纳入最终回购。对于我的repo（repo中没有重复的文件夹-实际上，它们来自tfs2git迁移），没有冲突，一切都是自动运行的。

它主要用于（参见名称）创建monoreos。

对于Windows用户：gitbash可以执行.sh文件。它带有标准的git安装。

另一个存储库的单个分支可以很容易地放在保留其历史的子目录下。例如：

git subtree add --prefix=rails git://github.com/rails/rails.git master

这将显示为一次提交，其中Rails主分支的所有文件都添加到“Rails”目录中。然而，提交的标题包含对旧历史树的引用：

从提交添加“rails/”<rev>

其中＜rev＞是SHA-1提交哈希。你仍然可以看到历史，责怪一些变化。

git log <rev>
git blame <rev> -- README.md

注意，从这里看不到目录前缀，因为这是一个完整的旧分支。您应该像通常的文件移动提交一样对待它：当到达它时，您需要额外的跳转。

# finishes with all files added at once commit
git log rails/README.md

# then continue from original tree
git log <rev> -- README.md

还有一些更复杂的解决方案，如手动执行此操作或如其他答案所述重写历史。

git子树命令是git contrib的一部分，一些数据包管理器默认安装它（OS X Homebrew）。但除了git之外，您可能还需要自己安装它。

如果两个存储库都有相同类型的文件（就像两个Rails存储库用于不同的项目），您可以将辅助存储库的数据提取到当前存储库中：

git fetch git://repository.url/repo.git master:branch_name

然后将其合并到当前存储库：

git merge --allow-unrelated-histories branch_name

如果您的Git版本小于2.9，请删除--允许不相关的历史记录。

在此之后，可能会发生冲突。例如，可以使用gitmergetool来解析它们。kdiff3只能与键盘一起使用，因此在读取代码时仅需几分钟，就会产生5个冲突文件。

记住完成合并：

git commit