对于那些使用SSH连接到MySQL数据库的人来说，这里似乎缺少一个答案。你需要检查两个地方，而不是其他答案建议的1:

工作台编辑→首选项→SQL编辑器→DBMS

工作台编辑→首选项→SSH→超时

我的默认SSH超时设置得很低，导致了一些(但显然不是全部)超时问题。之后，不要忘记重新启动MySQL工作台!

最后，你可以联系你的数据库管理员，让他们通过my.conf + mysql restart来增加mysql自身的wait_timeout和interactive_timeout属性，如果重启mysql不是一个选项，也可以做一个全局设置。

希望这能有所帮助!

我也遇到过同样的问题。我相信当您有较大表的外键时(这需要时间)就会发生这种情况。

我尝试运行create table语句再次没有外键声明，并发现它工作。

然后在创建表之后，我使用ALTER table查询添加外键约束。

希望这能帮助到一些人。

我知道它很老，但在mac上

1. Control-click your connection and choose Connection Properties.
2. Under Advanced tab, set the Socket Timeout (sec) to a larger value.

我在加载.csv文件时遇到了同样的问题。 将文件转换为.sql。

使用下面的命令，我设法解决这个问题。

mysql -u <user> -p -D <DB name> < file.sql

希望这能有所帮助。

新版本的MySQL WorkBench有一个选项可以更改特定的超时时间。

对我来说，它是在编辑→首选项→SQL编辑器→DBMS连接读取超时时间(秒):600

将值更改为6000。

此外，不勾选限制行，因为每次我想搜索整个数据集时都要设置一个限制，这会让人感到厌烦。

如果你的查询有blob数据，这个问题可以通过应用my.ini更改来修复，就像在这个答案中提出的那样:

[mysqld]
max_allowed_packet=16M

默认情况下，这将是1M(允许的最大值是1024M)。如果提供的值不是1024K的倍数，它将自动舍入到1024K的最接近倍数。

虽然引用的线程是关于MySQL错误2006，设置max_allowed_packet从1M到16M确实修复了2013年的错误，当我运行一个长查询时出现。

对于WAMP用户:您将在[wampmysqld]部分中找到该标志。