pandoc手册解释了如何使用头文件的标识符链接到头文件。我没有检查其他解析器对此的支持，但据报道，它不能在github上工作。

标识符可以手动指定:

## my heading text {#mht}

Some normal text here,
including a [link to the header](#mht).

或者您可以使用自动生成的标识符(在本例中是#my-heading-text)。在pandoc手册中都有详细的解释。

注意:这只适用于转换为HTML, LaTex, ConTeXt, Textile或AsciiDoc。

除了以上的答案，

当在YAML头中设置选项number_sections: true时:

number_sections: TRUE

RMarkdown会自动为你的章节编号。

要引用这些自动编号的部分，只需在您的R Markdown文件中放入以下内容:

(我的部分)

Where My Section是Section的名称

这似乎不管section级别都有效:

#我的部分

##我的部分

###我的部分

这可能是过时的线程，但创建内部文档链接markdown在Github使用… (注意:小写#title)

# Contents
 - [Specification](#specification) 
 - [Dependencies Title](#dependencies-title) 

## Specification
Example text blah. Example text blah. Example text blah. Example text blah. 
Example text blah. Example text blah. Example text blah. Example text blah. 
Example text blah. Example text blah. Example text blah. Example text blah. 
Example text blah. Example text blah. 

## Dependencies Title
Example text blah. Example text blah. Example text blah. Example text blah. 
Example text blah. Example text blah. Example text blah. Example text blah. 
Example text blah. Example text blah. Example text blah. Example text blah. 
Example text blah. Example text blah. 

这是一个很好的问题，所以我修改了我的答案;

可以使用- #，##，###，####创建到任何大小的标题的内部链接 我在下面创建了一个简单的例子… https://github.com/aogilvie/markdownLinkTest

是的，markdown确实做到了这一点，但你需要指定名称anchor <a name='xyx'>。

一个完整的例子，

这就创建了链接 (任务)(#任务)

在文档的其他地方，您创建了命名锚(不管它叫什么)。

<a name="tasks">
   my tasks
</a>

注意，你也可以把它环绕在标题上。

<a name="tasks">
### Agile tasks (created by developer)
</a>

在Markdown规范中没有这样的指令，抱歉。

Github会自动从你的标题中解析锚标记。所以你可以这样做:

[Custom foo description](#foo)

# Foo

在上面的例子中，Foo头生成了一个名为Foo的锚标记

注意:所有标题大小只有一个#，#和锚点名称之间没有空格，锚点标签名称必须小写，如果有多个单词，则用破折号分隔。

[click on this link](#my-multi-word-header)

### My Multi Word Header

更新

潘多克也不例外。