pandoc手册解释了如何使用头文件的标识符链接到头文件。我没有检查其他解析器对此的支持，但据报道，它不能在github上工作。

标识符可以手动指定:

## my heading text {#mht}

Some normal text here,
including a [link to the header](#mht).

或者您可以使用自动生成的标识符(在本例中是#my-heading-text)。在pandoc手册中都有详细的解释。

注意:这只适用于转换为HTML, LaTex, ConTeXt, Textile或AsciiDoc。

因为在评论中提到了MultiMarkdown作为一个选项。

在MultiMarkdown中，内部链接的语法很简单。

对于文档中的任何标题，只需以这种格式给出标题名称[heading][]以创建内部链接。

阅读更多:MultiMarkdown-5交叉引用。

Cross-References An oft-requested feature was the ability to have Markdown automatically handle within-document links as easily as it handled external links. To this aim, I added the ability to interpret [Some Text][] as a cross-link, if a header named “Some Text” exists. As an example, [Metadata][] will take you to # Metadata (or any of ## Metadata, ### Metadata, #### Metadata, ##### Metadata, ###### Metadata). Alternatively, you can include an optional label of your choosing to help disambiguate cases where multiple headers have the same title: ### Overview [MultiMarkdownOverview] ## This allows you to use [MultiMarkdownOverview] to refer to this section specifically, and not another section named Overview. This works with atx- or settext-style headers. If you have already defined an anchor using the same id that is used by a header, then the defined anchor takes precedence. In addition to headers within the document, you can provide labels for images and tables which can then be used for cross-references as well.

试验，我发现了一个解决方案使用<div…/>，但一个明显的解决方案是在页面中放置自己的锚点，无论你喜欢，因此:

<a name="abcde">

之前和

</a>

在你想要“链接”到的行之后。然后是一个降价链接:

[link text](#abcde)

文档中的任何地方都可以。

<div…/>解决方案插入一个“假”除法只是为了添加id属性，这可能会破坏页面结构，但<a name="abcde"/>解决方案应该是非常无害的。

(PS:把锚点放在你想链接的行中也可以，如下所示:

## <a name="head1">Heading One</a>

但这取决于Markdown如何处理。我注意到，例如，Stack Overflow答案格式化器很高兴这样!)

在pandoc中，如果在生成html时使用——toc选项，将生成一个包含到章节的链接的目录，并从章节标题返回到目录。它类似于pandoc编写的其他格式，如LaTeX、rtf、rst等。对于命令

pandoc --toc happiness.txt -o happiness.html

这里有一点降价:

% True Happiness

Introduction
------------

Many have posed the question of true happiness.  In this blog post we propose to
solve it.

First Attempts
--------------

The earliest attempts at attaining true happiness of course aimed at pleasure. 
Soon, though, the downside of pleasure was revealed.

将产生这个作为html的主体:

<h1 class="title">
    True Happiness
</h1>
<div id="TOC">
    <ul>
        <li>
            <a href="#introduction">Introduction</a>
        </li>
        <li>
            <a href="#first-attempts">First Attempts</a>
        </li>
    </ul>
</div>
<div id="introduction">
    <h2>
        <a href="#TOC">Introduction</a>
    </h2>
    <p>
        Many have posed the question of true happiness. In this blog post we propose to solve it.
    </p>
</div>
<div id="first-attempts">
    <h2>
        <a href="#TOC">First Attempts</a>
    </h2>
    <p>
        The earliest attempts at attaining true happiness of course aimed at pleasure. Soon, though, the downside of pleasure was revealed.
    </p>
</div>

pandoc手册解释了如何使用头文件的标识符链接到头文件。我没有检查其他解析器对此的支持，但据报道，它不能在github上工作。

标识符可以手动指定:

## my heading text {#mht}

Some normal text here,
including a [link to the header](#mht).

或者您可以使用自动生成的标识符(在本例中是#my-heading-text)。在pandoc手册中都有详细的解释。

注意:这只适用于转换为HTML, LaTex, ConTeXt, Textile或AsciiDoc。

除了以上的答案，

当在YAML头中设置选项number_sections: true时:

number_sections: TRUE

RMarkdown会自动为你的章节编号。

要引用这些自动编号的部分，只需在您的R Markdown文件中放入以下内容:

(我的部分)

Where My Section是Section的名称

这似乎不管section级别都有效:

#我的部分

##我的部分

###我的部分