Github会自动从你的标题中解析锚标记。所以你可以这样做:

[Custom foo description](#foo)

# Foo

在上面的例子中，Foo头生成了一个名为Foo的锚标记

注意:所有标题大小只有一个#，#和锚点名称之间没有空格，锚点标签名称必须小写，如果有多个单词，则用破折号分隔。

[click on this link](#my-multi-word-header)

### My Multi Word Header

更新

潘多克也不例外。

除了以上的答案，

当在YAML头中设置选项number_sections: true时:

number_sections: TRUE

RMarkdown会自动为你的章节编号。

要引用这些自动编号的部分，只需在您的R Markdown文件中放入以下内容:

(我的部分)

Where My Section是Section的名称

这似乎不管section级别都有效:

#我的部分

##我的部分

###我的部分

在pandoc中，如果在生成html时使用——toc选项，将生成一个包含到章节的链接的目录，并从章节标题返回到目录。它类似于pandoc编写的其他格式，如LaTeX、rtf、rst等。对于命令

pandoc --toc happiness.txt -o happiness.html

这里有一点降价:

% True Happiness

Introduction
------------

Many have posed the question of true happiness.  In this blog post we propose to
solve it.

First Attempts
--------------

The earliest attempts at attaining true happiness of course aimed at pleasure. 
Soon, though, the downside of pleasure was revealed.

将产生这个作为html的主体:

<h1 class="title">
    True Happiness
</h1>
<div id="TOC">
    <ul>
        <li>
            <a href="#introduction">Introduction</a>
        </li>
        <li>
            <a href="#first-attempts">First Attempts</a>
        </li>
    </ul>
</div>
<div id="introduction">
    <h2>
        <a href="#TOC">Introduction</a>
    </h2>
    <p>
        Many have posed the question of true happiness. In this blog post we propose to solve it.
    </p>
</div>
<div id="first-attempts">
    <h2>
        <a href="#TOC">First Attempts</a>
    </h2>
    <p>
        The earliest attempts at attaining true happiness of course aimed at pleasure. Soon, though, the downside of pleasure was revealed.
    </p>
</div>

是的，markdown确实做到了这一点，但你需要指定名称anchor <a name='xyx'>。

一个完整的例子，

这就创建了链接 (任务)(#任务)

在文档的其他地方，您创建了命名锚(不管它叫什么)。

<a name="tasks">
   my tasks
</a>

注意，你也可以把它环绕在标题上。

<a name="tasks">
### Agile tasks (created by developer)
</a>

通用解决方案

根据markdown的实现，这个问题似乎有不同的答案。 事实上，官方Markdown文档对这个话题只字未提。 在这种情况下，如果您想要一个可移植的解决方案，您可以使用HTML。

在任何标题之前，或在同一标题行中，使用一些HTML标记定义一个ID。 例如:<a id="Chapter1"></a> . 您将在代码中看到这一点，但在呈现的文档中看不到。

完整的例子:

请在这里查看完整的示例(在线和可编辑)。

## Content

* [Chapter 1](#Chapter1)
* [Chapter 2](#Chapter2)

<div id="Chapter1"></div>
## Chapter 1

Some text here.  
Some text here.
Some text here.

## Chapter 2 <span id="Chapter2"><span>

Some text here.  
Some text here.
Some text here.

为了测试这个例子，您必须在内容列表和第一章之间增加一些额外的空间，或者降低窗口的高度。 另外，不要在id的名称中使用空格。

因为在评论中提到了MultiMarkdown作为一个选项。

在MultiMarkdown中，内部链接的语法很简单。

对于文档中的任何标题，只需以这种格式给出标题名称[heading][]以创建内部链接。

阅读更多:MultiMarkdown-5交叉引用。

Cross-References An oft-requested feature was the ability to have Markdown automatically handle within-document links as easily as it handled external links. To this aim, I added the ability to interpret [Some Text][] as a cross-link, if a header named “Some Text” exists. As an example, [Metadata][] will take you to # Metadata (or any of ## Metadata, ### Metadata, #### Metadata, ##### Metadata, ###### Metadata). Alternatively, you can include an optional label of your choosing to help disambiguate cases where multiple headers have the same title: ### Overview [MultiMarkdownOverview] ## This allows you to use [MultiMarkdownOverview] to refer to this section specifically, and not another section named Overview. This works with atx- or settext-style headers. If you have already defined an anchor using the same id that is used by a header, then the defined anchor takes precedence. In addition to headers within the document, you can provide labels for images and tables which can then be used for cross-references as well.