我得到一个ValueError:当我试图将索引设置为某个值时,不能从重复的轴重新索引。我试图用一个简单的例子重现这一点,但我做不到。

这是我的会话在ipdb跟踪。我有一个DataFrame字符串索引,和整数列,浮动值。然而,当我尝试为所有列的总和创建和索引时,我得到ValueError:不能从重复轴错误重新索引。我创建了一个具有相同特征的小数据框架,但无法重现问题,我可能会错过什么?

我真的不明白ValueError:不能从重复的axis重新索引意味着什么,这个错误消息意味着什么?也许这将帮助我诊断问题,这是我问题中最有答案的部分。

ipdb> type(affinity_matrix)
<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
ipdb> affinity_matrix.shape
(333, 10)
ipdb> affinity_matrix.columns
Int64Index([9315684, 9315597, 9316591, 9320520, 9321163, 9320615, 9321187, 9319487, 9319467, 9320484], dtype='int64')
ipdb> affinity_matrix.index
Index([u'001', u'002', u'003', u'004', u'005', u'008', u'009', u'010', u'011', u'014', u'015', u'016', u'018', u'020', u'021', u'022', u'024', u'025', u'026', u'027', u'028', u'029', u'030', u'032', u'033', u'034', u'035', u'036', u'039', u'040', u'041', u'042', u'043', u'044', u'045', u'047', u'047', u'048', u'050', u'053', u'054', u'055', u'056', u'057', u'058', u'059', u'060', u'061', u'062', u'063', u'065', u'067', u'068', u'069', u'070', u'071', u'072', u'073', u'074', u'075', u'076', u'077', u'078', u'080', u'082', u'083', u'084', u'085', u'086', u'089', u'090', u'091', u'092', u'093', u'094', u'095', u'096', u'097', u'098', u'100', u'101', u'103', u'104', u'105', u'106', u'107', u'108', u'109', u'110', u'111', u'112', u'113', u'114', u'115', u'116', u'117', u'118', u'119', u'121', u'122', ...], dtype='object')

ipdb> affinity_matrix.values.dtype
dtype('float64')
ipdb> 'sums' in affinity_matrix.index
False

错误如下:

ipdb> affinity_matrix.loc['sums'] = affinity_matrix.sum(axis=0)
*** ValueError: cannot reindex from a duplicate axis

我试图用一个简单的例子重现这一点,但我失败了

In [32]: import pandas as pd

In [33]: import numpy as np

In [34]: a = np.arange(35).reshape(5,7)

In [35]: df = pd.DataFrame(a, ['x', 'y', 'u', 'z', 'w'], range(10, 17))

In [36]: df.values.dtype
Out[36]: dtype('int64')

In [37]: df.loc['sums'] = df.sum(axis=0)

In [38]: df
Out[38]: 
      10  11  12  13  14  15   16
x      0   1   2   3   4   5    6
y      7   8   9  10  11  12   13
u     14  15  16  17  18  19   20
z     21  22  23  24  25  26   27
w     28  29  30  31  32  33   34
sums  70  75  80  85  90  95  100

当前回答

简单地在最后使用.values跳过错误。

affinity_matrix.loc['sums'] = affinity_matrix.sum(axis=0).values

其他回答

当我把2个数据帧追加到另一个(df3 = df1.append(df2))时,发生在我身上,所以输出是:

df1
    A   B
0   1   a
1   2   b
2   3   c

df2
    A   B
0   4   d
1   5   e
2   6   f

df3
    A   B
0   1   a
1   2   b
2   3   c
0   4   d
1   5   e
2   6   f

修复索引的最简单方法是使用“df。reset_index(drop=bool, inplace=bool)"方法,正如Connor所说…你也可以设置'drop'参数为True,以避免索引列表被创建为列,并设置'inplace'为True,使索引重置永久。

这里是官方参考:https://pandas.pydata.org/docs/reference/api/pandas.DataFrame.reset_index.html

此外,还可以使用“。”Set_index (keys=list, inplace=bool)"方法,如下所示:

new_index_list = list(range(0, len(df3)))
df3['new_index'] = new_index_list 
df3.set_index(keys='new_index', inplace=True)

官方参考:https://pandas.pydata.org/docs/reference/api/pandas.DataFrame.set_index.html

确保你的索引没有任何重复,我只是用df。reset_index(drop=True, inplace=True),我不再得到错误了!但你可能想保留索引,在这种情况下,drop设为False

这也可能是这个原因[:)我是这样解决我的问题的]

即使你试图在dataframe中插入一个dataframe类型的列,也可能会发生这种情况

你可以试试这个

df['my_new']=pd.Series(my_new.values)

在我的例子中,出现这个错误不是因为重复的值,而是因为我试图将一个更短的Series连接到一个Dataframe:两者具有相同的索引,但Series的行更少(缺少前几行)。以下方法对我来说是有效的:

df.head()
                          SensA
date                           
2018-04-03 13:54:47.274   -0.45
2018-04-03 13:55:46.484   -0.42
2018-04-03 13:56:56.235   -0.37
2018-04-03 13:57:57.207   -0.34
2018-04-03 13:59:34.636   -0.33

series.head()
date
2018-04-03 14:09:36.577    62.2
2018-04-03 14:10:28.138    63.5
2018-04-03 14:11:27.400    63.1
2018-04-03 14:12:39.623    62.6
2018-04-03 14:13:27.310    62.5
Name: SensA_rrT, dtype: float64

df = series.to_frame().combine_first(df)

df.head(10)
                          SensA  SensA_rrT
date                           
2018-04-03 13:54:47.274   -0.45        NaN
2018-04-03 13:55:46.484   -0.42        NaN
2018-04-03 13:56:56.235   -0.37        NaN
2018-04-03 13:57:57.207   -0.34        NaN
2018-04-03 13:59:34.636   -0.33        NaN
2018-04-03 14:00:34.565   -0.33        NaN
2018-04-03 14:01:19.994   -0.37        NaN
2018-04-03 14:02:29.636   -0.34        NaN
2018-04-03 14:03:31.599   -0.32        NaN
2018-04-03 14:04:30.779   -0.33        NaN
2018-04-03 14:05:31.733   -0.35        NaN
2018-04-03 14:06:33.290   -0.38        NaN
2018-04-03 14:07:37.459   -0.39        NaN
2018-04-03 14:08:36.361   -0.36        NaN
2018-04-03 14:09:36.577   -0.37       62.2

今天当我想添加这样的新列时,我遇到了这个错误

df_temp['REMARK_TYPE'] = df.REMARK.apply(lambda v: 1 if str(v)!='nan' else 0)

我想处理df_temp的REMARK列以返回1或0。但是我用df输入了错误的变量。然后返回如下错误:

----> 1 df_temp['REMARK_TYPE'] = df.REMARK.apply(lambda v: 1 if str(v)!='nan' else 0)

/usr/lib64/python2.7/site-packages/pandas/core/frame.pyc in __setitem__(self, key, value)
   2417         else:
   2418             # set column
-> 2419             self._set_item(key, value)
   2420 
   2421     def _setitem_slice(self, key, value):

/usr/lib64/python2.7/site-packages/pandas/core/frame.pyc in _set_item(self, key, value)
   2483 
   2484         self._ensure_valid_index(value)
-> 2485         value = self._sanitize_column(key, value)
   2486         NDFrame._set_item(self, key, value)
   2487 

/usr/lib64/python2.7/site-packages/pandas/core/frame.pyc in _sanitize_column(self, key, value, broadcast)
   2633 
   2634         if isinstance(value, Series):
-> 2635             value = reindexer(value)
   2636 
   2637         elif isinstance(value, DataFrame):

/usr/lib64/python2.7/site-packages/pandas/core/frame.pyc in reindexer(value)
   2625                     # duplicate axis
   2626                     if not value.index.is_unique:
-> 2627                         raise e
   2628 
   2629                     # other

ValueError: cannot reindex from a duplicate axis

正如您所看到的,正确的代码应该是

df_temp['REMARK_TYPE'] = df_temp.REMARK.apply(lambda v: 1 if str(v)!='nan' else 0)

因为df和df_temp有不同的行数。因此它返回ValueError:不能从重复的轴重新索引。

希望你能理解,我的回答可以帮助其他人调试他们的代码。