我得到一个ValueError:当我试图将索引设置为某个值时,不能从重复的轴重新索引。我试图用一个简单的例子重现这一点,但我做不到。

这是我的会话在ipdb跟踪。我有一个DataFrame字符串索引,和整数列,浮动值。然而,当我尝试为所有列的总和创建和索引时,我得到ValueError:不能从重复轴错误重新索引。我创建了一个具有相同特征的小数据框架,但无法重现问题,我可能会错过什么?

我真的不明白ValueError:不能从重复的axis重新索引意味着什么,这个错误消息意味着什么?也许这将帮助我诊断问题,这是我问题中最有答案的部分。

ipdb> type(affinity_matrix)
<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
ipdb> affinity_matrix.shape
(333, 10)
ipdb> affinity_matrix.columns
Int64Index([9315684, 9315597, 9316591, 9320520, 9321163, 9320615, 9321187, 9319487, 9319467, 9320484], dtype='int64')
ipdb> affinity_matrix.index
Index([u'001', u'002', u'003', u'004', u'005', u'008', u'009', u'010', u'011', u'014', u'015', u'016', u'018', u'020', u'021', u'022', u'024', u'025', u'026', u'027', u'028', u'029', u'030', u'032', u'033', u'034', u'035', u'036', u'039', u'040', u'041', u'042', u'043', u'044', u'045', u'047', u'047', u'048', u'050', u'053', u'054', u'055', u'056', u'057', u'058', u'059', u'060', u'061', u'062', u'063', u'065', u'067', u'068', u'069', u'070', u'071', u'072', u'073', u'074', u'075', u'076', u'077', u'078', u'080', u'082', u'083', u'084', u'085', u'086', u'089', u'090', u'091', u'092', u'093', u'094', u'095', u'096', u'097', u'098', u'100', u'101', u'103', u'104', u'105', u'106', u'107', u'108', u'109', u'110', u'111', u'112', u'113', u'114', u'115', u'116', u'117', u'118', u'119', u'121', u'122', ...], dtype='object')

ipdb> affinity_matrix.values.dtype
dtype('float64')
ipdb> 'sums' in affinity_matrix.index
False

错误如下:

ipdb> affinity_matrix.loc['sums'] = affinity_matrix.sum(axis=0)
*** ValueError: cannot reindex from a duplicate axis

我试图用一个简单的例子重现这一点,但我失败了

In [32]: import pandas as pd

In [33]: import numpy as np

In [34]: a = np.arange(35).reshape(5,7)

In [35]: df = pd.DataFrame(a, ['x', 'y', 'u', 'z', 'w'], range(10, 17))

In [36]: df.values.dtype
Out[36]: dtype('int64')

In [37]: df.loc['sums'] = df.sum(axis=0)

In [38]: df
Out[38]: 
      10  11  12  13  14  15   16
x      0   1   2   3   4   5    6
y      7   8   9  10  11  12   13
u     14  15  16  17  18  19   20
z     21  22  23  24  25  26   27
w     28  29  30  31  32  33   34
sums  70  75  80  85  90  95  100

当前回答

对于仍在为这个错误苦苦挣扎的人来说,如果您不小心创建了具有相同名称的重复列,也会发生这种情况。像这样删除重复的列:

df = df.loc[:,~df.columns.duplicated()]

其他回答

我在同一个问题上浪费了几个小时。在我的情况下,我必须在使用apply函数之前reset_index()的数据帧。 在合并或从另一个索引数据集查找之前,您需要重置索引,因为一个数据集只能有一个索引。

简单地在最后使用.values跳过错误。

affinity_matrix.loc['sums'] = affinity_matrix.sum(axis=0).values

在我的例子中,出现这个错误不是因为重复的值,而是因为我试图将一个更短的Series连接到一个Dataframe:两者具有相同的索引,但Series的行更少(缺少前几行)。以下方法对我来说是有效的:

df.head()
                          SensA
date                           
2018-04-03 13:54:47.274   -0.45
2018-04-03 13:55:46.484   -0.42
2018-04-03 13:56:56.235   -0.37
2018-04-03 13:57:57.207   -0.34
2018-04-03 13:59:34.636   -0.33

series.head()
date
2018-04-03 14:09:36.577    62.2
2018-04-03 14:10:28.138    63.5
2018-04-03 14:11:27.400    63.1
2018-04-03 14:12:39.623    62.6
2018-04-03 14:13:27.310    62.5
Name: SensA_rrT, dtype: float64

df = series.to_frame().combine_first(df)

df.head(10)
                          SensA  SensA_rrT
date                           
2018-04-03 13:54:47.274   -0.45        NaN
2018-04-03 13:55:46.484   -0.42        NaN
2018-04-03 13:56:56.235   -0.37        NaN
2018-04-03 13:57:57.207   -0.34        NaN
2018-04-03 13:59:34.636   -0.33        NaN
2018-04-03 14:00:34.565   -0.33        NaN
2018-04-03 14:01:19.994   -0.37        NaN
2018-04-03 14:02:29.636   -0.34        NaN
2018-04-03 14:03:31.599   -0.32        NaN
2018-04-03 14:04:30.779   -0.33        NaN
2018-04-03 14:05:31.733   -0.35        NaN
2018-04-03 14:06:33.290   -0.38        NaN
2018-04-03 14:07:37.459   -0.39        NaN
2018-04-03 14:08:36.361   -0.36        NaN
2018-04-03 14:09:36.577   -0.37       62.2

df = df.reset_index(drop=True)为我工作

在我的例子中,这是由尺寸不匹配引起的:

在mul操作期间不小心使用了来自不同df的列